EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-26719 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:35882574-35884828 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr4:35883079-35883098TACCGACACCTGCTGGAAA-6.25
Foxq1MA0040.1chr4:35883209-35883220TATAAACAATA-6.32
IRF1MA0050.2chr4:35884788-35884809AGCCCGAAACTGAAAGCGAGA-6.09
IRF4MA1419.1chr4:35884791-35884806CCGAAACTGAAAGCG+6.34
IRF5MA1420.1chr4:35884791-35884805CCGAAACTGAAAGC+6.01
IRF8MA0652.1chr4:35884791-35884805CCGAAACTGAAAGC+6.55
ZNF263MA0528.1chr4:35884077-35884098TCCTCCTCTTTATTCTCCTCA-6.29
ZNF384MA1125.1chr4:35882781-35882793AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:35882874-35882886TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:35882875-35882887TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:35882876-35882888TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:35882877-35882889TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:35882878-35882890TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:35882879-35882891TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr4:35884118-35884130AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
CATGTTTTGA ATTGTCAAAG ACATCAAAAT ATTTGCAATA TTTCAACTCT TACAGGTTGA 60
ACTAAAATAA TTCTTGCAAA CTACATGATA AAGACAAAAT TATTTTTTTT TCCAGTGCCT 120
CCTGACATGC TGGTAACAAA CAAAACTGGC CTCGGTTTGA TAGAGCACAC AGGGCCGGAG 180
TTTTGCACTA AGGCTGGCTT TAGAACCAAA AAAAAAAAAC TAAAAGCGGT TTGTGTTGAG 240
GTGGTTCATC ATAAGATCAA CAATATATAT AATAATAATA ATATGTATCA CCTATAGCAG 300
TTTTTTTTTT TTTTTTTGTA ATTTCAAAGT ATTTTCTTTA AAATGACAAT AAGATATTGC 360
ATTTATTGTA TTGTATGTGG ATCTGGGGAG ACTACAAAAT TAGGTAGGCA GAAATACATT 420
TTTTGGCATG TTTCCTTCTT GCAGTTGTAA TAGAATAACT CTTGCATGTA TTATTAAAAA 480
AGAGAAATTT CGTTTTTTGT GTGTTTACCG ACACCTGCTG GAAAGAAATG AAATTGGTTC 540
CAGGGTGCTG GAGCACTCAA GGCCTGAGTT ACACATTTTC AAACTTCAGT TTATATAAAA 600
AGCGATTTTT TGTGTGTTTA TTTTAACACA GACAATATAA ACAATAATTG TACTTGTCAA 660
CAGTATTAAA TGTAATTTTA AAGGGTTTTC TTTAAAATGA TACTAAACTT TTGTATTTAC 720
TTCTATGCAT GGGGAAAACG GGACTATTCT CTTGCTTAAG TACAAATGAA TGATTTCTCT 780
CTAGTGTGGG TTAATATGTG TAGATTAAGG GATGATGATC GAGTGAAACT CTTCCCACAC 840
TGAGTGCATG TAAATGGTTT CTCTCCAGTG TGGATCATCA TGTGTTGATT AAGTTGTGAT 900
GATTGGTTGA AACTCTTCCC ACATTGAGTG CATGTGAATG GTTTCTCTCC AGTGTGGATC 960
CTCATGTGTC GAATAAGGTG TGATGAGCTT TTAAAACTTT TCCCACACTG AGTGCATGTG 1020
AATGGTTTAT TTCCGGTGTG GATCCTCATG TGTTGATTAA GGGATGATGA TTGGCTGAAA 1080
CTCTTCCCAC ACTGAGTGCA TGTGAATGGT GTCTCTCCAG TGTGGATCCT CATGTGTAGA 1140
TTAAAGTGTG ATAAGCAGTT AAAACTCTTC CCACACTGAC AGCATGTGAA TGGTTTCTCT 1200
CCAGTGTGGA TCTTCATGTG AATCTTAAGA TTGCCTTTTC TTCCAAAACT CTTTCCACAC 1260
TGAGTGCATG TGAATGGTTT CTCTCCAGTG TGGATCCTCA TGTGTTGATT AAGTAGTGAT 1320
GAGCTGTTAA AAGTCTTCCC ACACTGAGTG CAAGTATATG GTTTCCCTCC AGTGTGGATC 1380
CTCATGTGTT TATTAAGGGA TGATGATCGG CTGAAACATT TTCCACACTG AGTGCAGGTG 1440
TCTCTCCTTT TCAAAATACC ATCAGTGTGT AAATGAGTTT TTTCCTCAAT TTTGACACTA 1500
TGTTCCTCCT CTTTATTCTC CTCATTCTCT TCAATTAGGT CTGAAATAAA AAAAAATAAA 1560
ACATTAGTTT TCATTAAGTC TTTAAAACTC TCATCAAAAG CTGAAAAGTG AAAAGACACT 1620
GGAAACATTG GCTACACACT GTAAATTTGA TGCCCATTAA ATCTAAAATA AATCAGATCA 1680
TATTTTGTTT GGTCCCTTGC ACACATTTAA GCAAAATCAA TTTAATTATC TTTATGTATC 1740
TAGTGCTTTT ACAATGTAAA GTGTGCCAAA GCCACTTACC ATAGAAGTTA TAGTAAATTT 1800
AAACAGTGTC AGTCCAGTTT TCAGAGTTTC TTACATAATT GATTATAAAA GTCATTTTGG 1860
TCATATTGAT AAGACACAGA TTTGAAAAAA AAAAGAAAGA GGAAGAGAGT TGAAGTGGGC 1920
AGCATTATGT GGTGTGTGGA AGAAAGAGAA GTTGACTGAA CTGTTGCAGT GCGGGGAAAC 1980
AAGTAGAGAA ACCGTGTCAA GATGAGCAGT GTAAACTTAG GGCCTACTCA CACTATGCCA 2040
TCCGTACCGT GCCCAGGCCC GTTCCCCGGA TCGTTTGAGA AGTGTGAGTG CGCTGAATTG 2100
GGCTCAAGCA CAGTTCACTT GGCCGGCCCT GGCCCGGTTG GAAGAGGTGT GCCTGAGCCC 2160
GGTTCACTTA GGCTTTGGCG CGGTACGTTT GTGTGTGAGT GCAAAACGCG CCAAAGCCCG 2220
AAACTGAAAG CGAGACGTGA CTTTTAAGGG ACTG 2254