EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-26641 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:34245105-34246975 
TF binding sites/motifs
Number: 29             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArMA0007.3chr4:34245167-34245184AAGAACAAGATGTACTT+6.12
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Atoh1MA0461.2chr4:34246258-34246268AACGTATGTT+6.02
Atoh1MA0461.2chr4:34246258-34246268AACGTATGTT-6.02
BHLHE23MA0817.1chr4:34246257-34246269CAACGTATGTTT-6.52
Foxd3MA0041.1chr4:34245704-34245716GATTGTTTTTTT+6.44
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IRF1MA0050.2chr4:34246682-34246703AAAAAGAAAACGAAAACAAGA-6.03
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NR3C1MA0113.3chr4:34245167-34245184AAGAACAAGATGTACTT-6.04
NR3C1MA0113.3chr4:34245167-34245184AAGAACAAGATGTACTT-6.04
NR3C1MA0113.3chr4:34245167-34245184AAGAACAAGATGTACTT+6.19
NR3C1MA0113.3chr4:34245167-34245184AAGAACAAGATGTACTT+6.19
NR3C2MA0727.1chr4:34245167-34245184AAGAACAAGATGTACTT+6.03
NR3C2MA0727.1chr4:34245167-34245184AAGAACAAGATGTACTT+6.03
OLIG1MA0826.1chr4:34246258-34246268AACGTATGTT+6.02
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SOX10MA0442.2chr4:34245540-34245551AAAACAAAGGA+6.32
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Sox3MA0514.1chr4:34245540-34245550AAAACAAAGG-6.02
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Sox6MA0515.1chr4:34246842-34246852AAAACAATGG-6.02
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ZNF384MA1125.1chr4:34245531-34245543AAAAACAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:34245532-34245544AAAACAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:34245564-34245576TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr4:34245565-34245577TTTTTTTTTTAA-6.44
ZNF384MA1125.1chr4:34245566-34245578TTTTTTTTTAAT-6.74
ZNF384MA1125.1chr4:34245709-34245721TTTTTTTTTATA-6.92
Enhancer Sequence
TCACTTCCAG AACAGCGCGA GACCTCACAT GGAAAGGAGC CAAGGGAAAT GACTTTCTCA 60
AGAAGAACAA GATGTACTTC AAAGAAGACT TCACGATCAA AGACAGGGCT ACGCGGAATC 120
TCCTTTGGCC GTCAATCGAC AAAGCCAGGA AAGAGGGAAA AAAGGCCTTC TTTGTTGGAA 180
TCAAGGCAAT AGTTGATGGT AAAGAAATTA AGATATAAAT TGCTCTAAAT ATAGGTTTTA 240
GACACTGATT TTTTTGTAAC ACAAAAAGTT CTAGCTACAT TGTAATTTTG TTAATGATGT 300
GACCTCTTTA AAATATATAT AATTTATTTT CCTTTCACTC TTTAAATGTA TACATATTTG 360
TTACTGATAA TTTCAATAAC ATATTTTCCA TAAAAAATAG TTACTTTGTT TTGTGGTACA 420
CAGAAAAAAA ACAAAAAAAC AAAGGAGGTC ATTTATCTAT TTTTTTTTTT AATCAAAGCG 480
AAAAGGATTT CAGGACTAAG TTAACGTGAC TGATTTTTCA AAGACGGAGG GAATTTTTTA 540
CCCGTTATAC ACTCTCAACA CTCTTAAACC TTATTCGGTT GTTGTTCACT TGTTCACTTG 600
ATTGTTTTTT TTTATAATTA AGGATTGTAT ATTTTTTTGA GTTATGTCAA TAACAATATT 660
TTCTGTTAAT GCCAGGGGTA TACGAGATTT GCTAAAAAGA AAGGCTTTGT TTCTGTTTTG 720
TAAAAGTAAA AAGGCTGACT TTTGCTTTAT TCAAGAAACT CATGCCTGCA AAGAAGATGT 780
GTCTTTTTGG AAGAGTCAAT GGGGTTGTGA CATTTGGTTT TCTTTTGGCG CTTCAAATAG 840
ATCAGCAGGT GTCGCTATTT TAAAAGATAA GTTTTTAGGG AAGACAATAA CTCAAAAATC 900
GGATGATAAT GGCCGCTGGG TCATTCTACT TGTTGAAATA AACCAGGTAC AATTTATTAT 960
TGTAAATATT TATGCCACCA ACAATAAAAA AATAAATGGA TTAATTTTTC AAGATATTGA 1020
AGGTCATATT AATAACTTGC AATTAAAATT CCCTTCAGCT GAAGTTATTT GGGGTGGTGA 1080
CTTTAACACT ATTTTTGATG GACAACAAGA TAGATTGCCC CCGAAAGTTG ACTATAGTGC 1140
AAATGAATTA AGCAACGTAT GTTTAAGGTT AAATATAGTT GACATTTGGA GGTATAAGAA 1200
TACAAATTCC TTAGCATATA CTTGGTCTAA TAGGGATGGA TCTCTCCAAT CGCGTATTGA 1260
CTTTTGGCTT ATATCAGAAA GTATGAAAGA AAAAGTAGAA TATGTGAATA TTGAACCATC 1320
TGTTTTAACT GATCACAAGG GCATATCAAT AAAAATTTGT ATTTCAGGCC ATCAGTCAGA 1380
CAGGGTTAAG AGGGGATACT GGAAATTAAA TAATAATTTG CTGAAATGTA AAGAGTTTGA 1440
AGCTCAAATT AAAACCTTAA TTATTAAATA TTGGAAACAG GCATGTATGA CCCAAATGTA 1500
TGGAAAATAC TGGGAACAAA CTAAATTTGA AATAAGAAAA CTCGCTATAT CCTATGGAAA 1560
GTCTATTGCA AAGAGGAAAA AAGAAAACGA AAACAAGATA ATTAGTGACA TTTATTCTAT 1620
TATGTGCAGA AGTAACCAAG ATATGTCAAG CAATGATGTA TTAAAACTTA CAACATTGCA 1680
GAACGATCTA GACAATATTT ATGAAGAAAA AGCAAAAGGT GCATTTGTTA GGTCAAGAAA 1740
ACAATGGATG GAAGCCGGAG AAAAGAATAC TAAATATTTT TTTAGCTTAG AAAAAAGGAA 1800
TCGGGAAATT TCATCTGTTA ATAAATTAAT AATAAATAAT TCTATCAATG AAAATCCTAA 1860
GGAGATTTCT 1870