EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-26525 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:32002669-32003796 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr4:32003756-32003767ATTTTAATTAA+6.62
RUNX1MA0002.2chr4:32002958-32002969AAACCACAGAA-6.32
SOX10MA0442.2chr4:32003335-32003346TGCTTTGTTTT-6.02
Enhancer Sequence
AGCAGCAAAT CTGCATATTT ATTAAGTTCT GAAGAATCAT GTGATGTGAA ATTTAATACC 60
ACGTTTCAAT ATCAAAACTT TCTTAAAATA ACTGCAATAA AGACAAGTAA CAGATGCATA 120
ATATATAGAC ATGTAGCGTG TGCATAATGA TGTGCAATGG AAATTCATAT GAATTAATCC 180
TCTGCTTAAA GTTACCTGTC TTTCCTGCAT CTCTGTGATC AGCTCCCTGC AGAAATTTAG 240
GAATCTTGTG TTATATTTTC TGTAGCAGGG GGTTATTCTC TCACTCCTGA AACCACAGAA 300
CACTTTTTTT ACTTAACATT TGTTTAAGAT ACCATGAAAT ATCAAAACAC GATTGAACTT 360
TTGATTCACG GTCCTTTACA GTACAATGCG TATTTTACAC TACATATGGA GTGCATTCAA 420
TAAAACATTG ACAAAACCTC TCATCTACAC ATAAAGAATA AATAAAAGCC AAAACTTTAA 480
CAAACAAGTT TAACAATAGC TAACATTAAG TAAGTTAACG TAATATTACC CCGACGCTAA 540
CGTTACCAGT GCTAATATGC TAACGGACTT TTACGAAGAC TTACCACGCT TATATAACAT 600
ATTATTCAAC TGAATATTCA TCAATTGCCA ATAATAAAAG TGTGAGGAAC AGTTTTATGT 660
AGTATTTGCT TTGTTTTAGG GACTAAACTT ACCTGAAAAT AGTCAAAACG GCAGCTTGAG 720
AGAAGTCGTG TTGTGTCTTT CAGGTGTGGT GTCGTGTCGT GTTGTAGCTT CGTTTCCCAT 780
AGCAACATCC TCTCCGCTCC AGTGTTGGAA TGAGACGCGC GCGCGCACAT CAAAGTCATG 840
CAGTATTACA TTTATAAACA TGACAACTCC ATAGACAATT TAAATAATAA CCTTGTATTT 900
TATATCTTGA ATTTAAAATG TATTTAGCAG TTTTATATAC GCTATTATCT TTAAGACGAG 960
CTTTATTGCC TACTAACTGT TACAAAACAA ACACTTTATT TGTGCAACAG ATTCACTGTC 1020
AAAATAACCA ATAAATATAA ATGCAAGTAT ATATAAAACA AAGATGTCAC TCTGTAAAAA 1080
GGGGTTTATT TTAATTAAAC AGCCGAAATG CAGAACATAC TTGATTT 1127