EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-26513 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:31889531-31890555 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr4:31890453-31890470TGAGTTAATTAATTCGT+6.59
Alx1MA0854.1chr4:31890452-31890469GTGAGTTAATTAATTCG-7.1
Alx4MA0853.1chr4:31890452-31890469GTGAGTTAATTAATTCG-6.68
EOMESMA0800.1chr4:31890192-31890205AAGGTGTGATAAA+6.23
Foxq1MA0040.1chr4:31890438-31890449TATTGTTTATT+6.62
Lhx3MA0135.1chr4:31890455-31890468AGTTAATTAATTC-6.15
Enhancer Sequence
TGTGTGTTTA AGAAATGTTT AGTGTTGTTA TAAGAGTTAA ATAAAAATGC ACTAAATTTT 60
CAGGAGTGAT GTTTTGTATG ATTATTTATG TCAATGTATC TGCATTTAGA CATAAGATTT 120
TTTAGAGGCA GTCAAACAAA CATTAATAAA CTTTGTAGAA TAAATATTGA CTGTTGTTTA 180
TTTATGTGAG TTACAATCAT AGACCTGCAC ATTTTTAAGT AGATATAAAA ATATATGACT 240
ATTAAAGTAC AGTTACATTC ATTCTTTGTT GTAATAATAA CAGTACCTAA AAATAAAGAA 300
TAAAAACTTT TATTATACAG AATCCAGTTT AAAGAGCTTA GTTTTACCAG TTTGTTAGCA 360
AAGCAATATT TATGCAGTGT CACATCCGAG GAACTGAGTG TCTTTGAAAA TATTATGTGC 420
AGTTTACAGT TTAAGAATAA AAGCATATTT ATTTAAAATT TAGTTAGCAA AAATTGTATC 480
AAACAAATTA TTGTTTGGGC CTTAAATGGA AAAGTTTCTT TGGTCAGAGT TTCTTTTGTC 540
AAAGTTTCTT TGATCAGAGT TTCTTTTAGA TTAGGCAGGG TCCACAGCCC CACACCCCTG 600
CTGTTTTGAA ACTCAAACAC ATCAGTGTAA ATGGGGCCTG GGATTTTCAC AGATAAAACC 660
AAAGGTGTGA TAAAAGTGGT GTGCATCAAA CCCATTCCCA CACCTCTCCA ATTAAGCACA 720
AAAACTTGAG TTTGAATCAA ACAATGTCTT TGTAACTTTT CCATTCAAAT TGTGAATCCT 780
GAATTACCCA AATTCTTATT TTGTATAGTT TTAATGTCAA GGTATTTGCA TTTGGACATA 840
AGATAAGTAT TTATTTTCAA GAGCAGTTAA ACTAACATTA ATAAAGTTTG CAAATGAAAA 900
TATTGATTAT TGTTTATTCA TGTGAGTTAA TTAATTCGTT AATTTTAAGC AACTGTTTGG 960
TAAACTGTTG TTGAAACATG TACAAAAGGA ATGTAAACCT GATTTTTTGG TCATTTGATA 1020
AATG 1024