EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-26479 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:31387736-31389660 
TF binding sites/motifs
Number: 25             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF14MA0740.1chr4:31387826-31387840AGCCACGCCCCCCA+6.26
KLF16MA0741.1chr4:31387827-31387838GCCACGCCCCC+6.62
KLF16MA0741.1chr4:31388034-31388045GCCACGCCCCC+6.62
KLF16MA0741.1chr4:31388180-31388191GCCACGCCCCC+6.62
KLF16MA0741.1chr4:31388326-31388337GCCACGCCCCC+6.62
NR4A1MA1112.2chr4:31387924-31387934TAAAGGTCAC+6.02
SP1MA0079.4chr4:31388031-31388046CAAGCCACGCCCCCA+7.61
SP1MA0079.4chr4:31388177-31388192CAAGCCACGCCCCCA+7.61
SP1MA0079.4chr4:31388323-31388338CAAGCCACGCCCCCA+7.61
SP1MA0079.4chr4:31387824-31387839CAAGCCACGCCCCCC+7.85
SP3MA0746.2chr4:31388033-31388046AGCCACGCCCCCA+6.34
SP3MA0746.2chr4:31388179-31388192AGCCACGCCCCCA+6.34
SP3MA0746.2chr4:31388325-31388338AGCCACGCCCCCA+6.34
SP3MA0746.2chr4:31387826-31387839AGCCACGCCCCCC+6.74
SP4MA0685.1chr4:31387824-31387841CAAGCCACGCCCCCCAA+7.06
SP4MA0685.1chr4:31388031-31388048CAAGCCACGCCCCCAAA+7.18
SP4MA0685.1chr4:31388177-31388194CAAGCCACGCCCCCAAA+7.18
SP4MA0685.1chr4:31388323-31388340CAAGCCACGCCCCCAAA+7.18
SP8MA0747.1chr4:31388034-31388046GCCACGCCCCCA+6.11
SP8MA0747.1chr4:31388180-31388192GCCACGCCCCCA+6.11
SP8MA0747.1chr4:31388326-31388338GCCACGCCCCCA+6.11
SP8MA0747.1chr4:31387827-31387839GCCACGCCCCCC+6.44
ZNF263MA0528.1chr4:31389615-31389636TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCC-6.05
ZNF263MA0528.1chr4:31389621-31389642TCTTCTTCTTCTTCCTTCTTC-7.07
ZNF263MA0528.1chr4:31389618-31389639TCTTCTTCTTCTTCTTCCTTC-7.37
Enhancer Sequence
ACAGTACATG GCAGTGTCAT ACAGACTTGG GGGTTGGCTA ACTTGACTGA GGCAACCAAT 60
CAGCATCTCA ATATGATTTT GAAGCTCACA AGCCACGCCC CCCAAATCAT TTAAAGCCCC 120
TTAATATCTG CCCCATTGAC TTAACATGGG GTGGGATGTC CCATTGCAGA TCCCATTGAC 180
TTCCATTATA AAGGTCACAC ATCTATAACA TTACATAGGA GTGTCATAGA GACATGGGGG 240
TGGGCTCATT TGACTCAGGC AACCAATCAG CATCACTATA TGATAATGAA GCTCACAAGC 300
CACGCCCCCA AATTGATCCC ATAGACTTCT ATTATAATTG GGCTAGATGC ATATCTTTGC 360
ATTGCAGTGT CATACAGGCT TAGGGGTTGG CTCATTGGAC CCAGACAACC AATGAGCATC 420
TCAATATGGT AATGAAGCTC ACAAGCCACG CCCCCAAACA GGACCCATAG ACTGCCATTA 480
TAACTGGCCT ACATGCATAT CTTTGCTTAG CAGTGTCCTA TTGACTTGGG GGATGGCTCA 540
TCTGACTCAG ACAACCAATG AGCATCTCGA TATGATAATG AAGCTCACAA GCCACGCCCC 600
CAAATTGGTC CCATAGACTT CCATTAAAAT AGGCCTACAT GCATATCTTT GCTTAGCAGT 660
GTCCTATTGA CTTGGGGGTT GGCTCATTTG ACTTGGACAG CCAACCACAT TCAAGTTCAC 720
TCTGTAACCT CGCCCATAGC AACAAAACAG AGTACCCTAG CAACCATTCA TCAACAGCTA 780
TATCTCAGCA TCGGAACATC GTAGAGACTT GGGGATTGGC TTGTTTGACT CATGCTAGCA 840
AACGGAACTT CCTGTATGCT ACACATGCTA GCAGTGACTA GCTACATGCT AATATTGACT 900
AGCCAAGTAC TGTAACTTGC TAGAAATGCT TACTAAGTAT AATTATTTCA TCAGGCATGT 960
ATATGAGGCT TGCCTAGTAA CCACCCCGGG TACCCTAGCA ACTGCCTAGC AACCACTCAA 1020
ATTACCCTAG CAACCGCCTA GCAACCACCT AGCAACCACC TAGTAGCGCC TTAGTAAGGG 1080
CCTAGCGACC ACTCAGGACA CCCTAGCAAC CGCCTAGCAA CGCCTTAGCA ACCACTTAGA 1140
ATACCCTAGC AACCACCTAG CAACGCCTTA GCAACGACCT AGCAACCACT CAGGACACCC 1200
TAGCAACCGC CTAGCAACAC CTTAGCAACC ACCTAGCAAC CACTCAGAAC ACCCTAGCAA 1260
CCGCCTAGCA ACGCCTTAGC AACCACTTAG AATACCCTAG CAACCACCTA GCAACACCTT 1320
AGCAACCACC TAGCAACCAC TCAGGACACC CTAGCAACCG CCTAGCAACA CCTTAGCAAC 1380
CACCTAGCAA CCACTCAGAA CACCCTAGCA ACCGCCTAGC AACTGCCTAG CAACCACTCA 1440
GAACACCTTA GCAACCACCT AGCAACCACT CAGGGCACCC TAGCACTGTT GCTAGCATGA 1500
TGCTAGCAAC TCGATTAGCA TGTTGCTAGC ATCATGCTAA CACGATTAGC ATCATGCTAG 1560
CTACATGCTA ATCAAGTTAG CATGATGCTA GCAACTCGAT TAGCATGTTG CTAGCATGAT 1620
GCTAACACGA TTAGCATCAT GCTAATTACA TGCTAATCAT GTTAGCATGA TGCTAGCATC 1680
TCGATTAGCA TGTTGCTAGC ATGATGCTAA CATTATTAGT ATCATGCTAG CTACATGCTA 1740
ATCATATTAG CATGTTGCTA GAACCTCGAT TAGCATGTTG TTGCTTTTTG GCCAGTACAG 1800
TGATGCATTT TACCCCATCG ATTTGCCACG CAAACCCCAT TCACATTTCC TTTAGGAAAT 1860
GTACAATTCT AGTTATTCTT CTTCTTCTTC TTCTTCTTCC TTCTTCCGTC CTATTTTTCG 1920
GCGC 1924