EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-26409 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:30159529-30161959 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF4MA0039.3chr4:30159800-30159811GCAGGGTGTGG-6.62
NEUROG1MA0623.2chr4:30160895-30160905GACATATGTC+6.02
NEUROG1MA0623.2chr4:30160895-30160905GACATATGTC-6.02
RESTMA0138.2chr4:30159604-30159625CCCAGTACCCTGGCCAGCAGC+6.65
SOX13MA1120.1chr4:30161898-30161909AAACAATGGAA+6.32
TFAP2A(var.3)MA0872.1chr4:30160918-30160931AGCCCCCAGGGCA+6.08
TFAP2A(var.3)MA0872.1chr4:30160918-30160931AGCCCCCAGGGCA-6.59
TFAP2B(var.3)MA0813.1chr4:30160918-30160931AGCCCCCAGGGCA-6.07
TFAP2B(var.3)MA0813.1chr4:30160918-30160931AGCCCCCAGGGCA+6.33
TFAP2C(var.3)MA0815.1chr4:30160918-30160931AGCCCCCAGGGCA+6.3
TFAP2C(var.3)MA0815.1chr4:30160918-30160931AGCCCCCAGGGCA-6.42
Enhancer Sequence
CTATAAAAAA TTTAAATGAA ACACGGGACT GTCATAACTC TATACTTCTG TACGTATCCC 60
AGGAAGGCCA GGAAACCCAG TACCCTGGCC AGCAGCAGCA ACCCCACGGC ACATGTTCCC 120
TACCACCACA CCACAGAGAT GGACATGCTT CCACCCAGGT GGTGGAAGAA AAAAGCCCCC 180
CGCAAGAGCC CCTCACAGCT GCATGGGCAG GCCCCATCGG GCCGAAAATG GCAACCGCTG 240
ACAACACCAT GCAGCCAGCC GCCTGGGACA GGCAGGGTGT GGAGCCAAGG GCCTTACGGG 300
CCCAAGAGCA GCCCTTCCCC CAGTGCTTTT CCAGTTCAAA CCCAATGCCA CTTTGCTCAT 360
AAATATGCCA TGTACGACCC ATATTTGTGT TCTCAGTTCA AACCCATGCC CACTTGGCCC 420
ATAAATATGC CATGCAGGAC CCATATATGC ATTCCCAGTT CAAACCCATG CCCAGTTGGC 480
CCATAAATAT GCCATGCAGG ACCCATATAT GCATTCCCAG TTCAAACCCA TGCCCAGTTG 540
GCCCATACAT ATGTCATGCA AGACCCATAT GTGCGTTCCC AGTTCAAACC CATGCCCAGT 600
TGGCCCATAA ATATGCCATG TAGGACCCAT ATTTGTGTTC CCAGTTCAAA CCCATGCCCA 660
CTTGGCCCAT AAATATTCCA TGCAGGGCCC ATATATGCAT TCCCAGTTCA AACCCATGCT 720
CAGTTGGCCC ATAATTAGGC CACGCAGCAC CCATAAATGT GTTCCCAGAT CAAACCTATG 780
CCCACTTGGC TCATAAATAT GCCATGCAGG ACCCATATAT CCATTCCCAG TTCAAACCCA 840
TGCCCACTTG GCCCATAAAT ATGCCATGCA GGACGTATAT ATGCATTCCC AGTTCAAACC 900
CATGCCCACT TGGCCCATAA ATATGTCAAT CAGGACCCAT ATGTGGGTCC CCAGTTCAAA 960
CCCATGCTCA GTTGGCCCAT AAATATGCCA TGTAGGACCC ATATTTGTGT TCCCAGATCA 1020
AACCCATGCC GACTTGGCCC ATAAATATTC CATGTAGGAC CCATATATGT GTTCCCAGAT 1080
CAAACCCATG CCCAATTGGC CCATGCCTGT CCCTTATGGC GCCCATGTTA TAAGCTCATA 1140
TGGGCTTCCT ATGTGGGACT CATTCTAGAA AACGTACATG GGACCTTCTG ATTTCACCCA 1200
GCCAAAGCCC ATGCCCACAC AGTTCCCATG GAACCCGTAG TTAGTCCATC TGGGCCCGAC 1260
ATATCGTTGC TGGCTGGGCA ACTTCCATTA AATGGCCACA ACGCAGAGTA CTAACCACTA 1320
TACTATCACG GCGAGCTACG GGAAAGCCGC TGGACGTTCA TTCTCTGACA TATGTCTTTA 1380
AAAATGGAAA GCCCCCAGGG CAGCTAGCAG GCAAATGCTA CCGTTTTGCT TTTCCCTTCC 1440
AGCACATCAC CTTTTCCCAA GAAACAATAG AATTGCAAAC AATCATGGAA GGTCGCAAAC 1500
TAAGTCCTGC GCACTGCCTG CCTGTGCATC CAGATGAAAC TTTCAGCAAG CGATAGCTCA 1560
ACGGCAAAAG CTGTGGCTCC ACGAAAAGTC CTATACGCCC AATCAGGGAC TTGAACCCTG 1620
GACCCTCAGA TTAAAAGTCT AATGCTCTAC CGACTGAGTT ATCCGGGCTC CAAGGCAAAA 1680
CTTTACAAGT AGGTAATGTT AATAGTTGTG TTCGGCGCAG ACCTTTACGG TACACAAAAG 1740
TTTACCGTGA GGTGGGGTTT AGGCTTATGG TTGGTGTAGA TGTTGCTAAA ACACAACAGA 1800
TTACTGTGAG GTTGGGTTTA TGGTTGTTGT AGGTGAAGAC ATCAGTACAA CACAATAGAT 1860
AGGACTCCAT GTCATGTAGG AGACATTAAA TGGATCAAAA GCAACTGCAG AAGGTCTCTC 1920
TGTTGTTGTG GCAATGAATG GAGACTTAAC AATTGAAAAG ATTCCTTCCA TGCCTTAGAA 1980
GCATGACTTG ATCAGTGCTT ATCTACACAG CATGCTGGCA TCAAAGGTCC CATTGCTCAT 2040
ATCGAATCCC TAGTCTTCCA CACTTTAGGA AACATTCAGG ACGTTCCAGT AGCACAGCCT 2100
GCACTAAAAG GAGGCTGGAG ATTAAGGATG GCGACACAGA GTGCAACGCC ATTGTCACCT 2160
TGAAAAACCT GCCGTGACTC GGATTCGGAC CGGGGTTGCT GCGGCCACAA CACAGAGTAC 2220
TAACCACTAT ACGATCACGG CGAGCTATGG GAAAGCCGCT GCTCATTCAT TCTCTGTCAT 2280
ATGTCTTTAA AAATGGAAAG CCCACAGGGC AGCTAGCTGG CATCTGCTGC CGTTTTGCTT 2340
TTCCCTTCTA GCACATCCCT TTTCCCAAGA AACAATGGAA TTGCAAACAA TCATGGAAGG 2400
TCGCAAGCTA AGGTCTGCGC ACTGCCTGGA 2430