EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-26396 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:29747555-29748623 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr4:29748263-29748284TAAACGAAAGTGAAAGTGTTT-7.16
IRF2MA0051.1chr4:29748267-29748285CGAAAGTGAAAGTGTTTA+6.89
IRF7MA0772.1chr4:29748266-29748280ACGAAAGTGAAAGT+7.58
IRF8MA0652.1chr4:29748266-29748280ACGAAAGTGAAAGT+6.11
IRF9MA0653.1chr4:29748265-29748280AACGAAAGTGAAAGT+6.56
Enhancer Sequence
TATAGCATAG CTTTCGATGT GTAATTTTGA GCATGAAATT AACCGTTTTG ACAAATTTGT 60
GAGGTGTGTT GCAGCTTTAT GATTTTGGAA CACTTATTAA ATGTATTGAA AAAACTGTCA 120
TAGACATTGT AAAAAAATTT TAATAACAGC TATGCGCTGT AGTTTTGAAG GAATGGACAC 180
AACTTTAAAA TCAAATGCTT TCTGCTATAG CTGCGTTAAT GAAACTCATC TTAAAACATT 240
CCTTTAGGGG CCAACACACA CCTTGTGAAG TTGTGATGTA AAGCTGTAAG CATAAAAATA 300
CTCTACATAT ATTTTATAAC CACATCTTAT TATTACATTT GTATCTTTAA ACTTTTTAAA 360
GCTGATAATT GTGAATTTCA TTGGTTTGAG AACATTTTGT GAGTCAACCC AGTGGATGGA 420
ACAATTGTGT GTTTACGCTT GTCGTTTAGT AGCTACTTTG TTGACGGTCC CTACCTGTTT 480
GTTTTCATTA CAATATAGGT TGCCTTTCAA AGAAGCAGAT TGACACAGAA ACTACGCGGT 540
GTGTTCTCTT GTGCATTTTC AAACACGCAA CACAACCAGT TTTTATTCAT ATTGTGATTT 600
TTTCTGGCTC TATTAGACTG TTTTAAAACT GATTCAACTT TACATCGGTG GTTCACCGTG 660
TTTGTGACGA CCGTTTATCA CTGAACTCGC GATGTGCTGC TGCCTTTATA AACGAAAGTG 720
AAAGTGTTTA GTTTTTGTCT CACCATTTTA AACATATTCC ATAATTTACA ATACAGAATA 780
GCTTCAAATC TTTAATGTCT TGAGAAAATG AGTAAGGTTT ATGTGATGTA TTATATATTT 840
TTCATCCTAA ACAAACTGAT GATGGCTGGA TTTCAATGAT TTTAGTGTCA CAGCTGCTGA 900
ACTATTCCTG CATTCAGCTT AATTATGAAG ACTGCTCAAA GACTGGATAT CTGTGATTGT 960
TTATCAGTGT CTTCTAGAGT TTTTGCTGGA GATCAAACTC TTCAGATCCA TCATGGAAGA 1020
CAAACACACT TCTGGAGATC AGAATTTGCT TCCAGGATGC AGGTATTA 1068