EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-26310 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:28540159-28540591 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr4:28540308-28540325TGAATTAATTAATCTAC+6.72
ArxMA0874.1chr4:28540308-28540325TGAATTAATTAATCTAC-6.57
IRF1MA0050.2chr4:28540189-28540210ACTAACTTTCATTTTTGTTTT+6.73
Lhx3MA0135.1chr4:28540309-28540322GAATTAATTAATC+6.54
POU6F1MA0628.1chr4:28540311-28540321ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:28540311-28540321ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
ACCAGGGGAC CCCCAAGAGT GAATGAAATT ACTAACTTTC ATTTTTGTTT TAGTTTGTCG 60
GAGAGTTTGG TTATAGATTA TGGGTGGGGC AAATATATCA ATATGCTCTG GCGCCAAGAA 120
TCGATATTTA TCTAAATGTA CAAAAGATCT GAATTAATTA ATCTACTCTG ACTGCAGCCA 180
TTTACCGCTG TGGCTGCAGT ACACCCAGCT GCCACCAAGT GGCTCTTCCC GTAATGGTGG 240
ATCAACAATA CATCAGAGAC GCACCAGCCT TTTTAACCAC TGACAGATGA GCGATTGCAA 300
TTGTGAAACT TTATACAGGA ATATGGGCTC ACACTATTTA TTTCCGCCAA AATATATATA 360
GATATCAATA GGACAAGAAC ACATAATTTG AAGGGTTTTT CATTTATTTA ACCCTTGCGG 420
ACCTTTGCAA AG 432