EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-26289 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:27139523-27141821 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr4:27139987-27140002TCTGTTTGTTTAATA-6.03
NEUROD2MA0668.1chr4:27139953-27139963GCCATATGGT+6.02
PBX2MA1113.1chr4:27139543-27139555TTGATTGACAGA+6.11
RFX2MA0600.2chr4:27141655-27141671CGCTGCCATGGTAACC+6.03
RFX2MA0600.2chr4:27141655-27141671CGCTGCCATGGTAACC-6.07
RFX3MA0798.1chr4:27141655-27141671CGCTGCCATGGTAACC+6.32
RFX3MA0798.1chr4:27141655-27141671CGCTGCCATGGTAACC-6.32
RFX5MA0510.2chr4:27141655-27141671CGCTGCCATGGTAACC-6.38
RFX5MA0510.2chr4:27141655-27141671CGCTGCCATGGTAACC+6.63
ZNF384MA1125.1chr4:27139629-27139641ATTAAAAAAAAA+6.74
Enhancer Sequence
GAATATTTAA TAATTTTTGT TTGATTGACA GACACGTGTA AAATCGTGGC AAAAGATTTT 60
AAAAAAGTTT AATTTGACAC ATAATATGTA AAGACCAAAT GTAATAATTA AAAAAAAATG 120
CTAAAAACGA TTACGTTTTC TGACAGTTGT CAAGACATAA CGTACGTTGA GGCATATCAT 180
AATAATACAA ATTAAAGTGG TCATCCGTCA GAAAAAATAA GACTGTGCCA TTATATATGC 240
ATGTAGTTTT GTAGTAATAG AACATACAAT TCATATATTT CTACTGAGGA AGTTCCTCGT 300
CGGCTCGAGA TCCTAAACAC GCTCTCGCGA CCCCACGAGA TGTAGGCGCT AGCTCAAGCT 360
ACCAATGCTA GCGGCTAACA CGTTAGCTCG CAGACAAAAA CAACAGGAAA ACACTTCACG 420
GTTCTCTCCT GCCATATGGT TGTAAATAGC TGGAGTTACT TGATTCTGTT TGTTTAATAC 480
TTAACGTTAA TATGCAAAAC ATTTGCTACA TAGTTAAAAT GCATATATGG AAACATTTAA 540
AGACAAAACG TGAGGATTTG ACTTAGTGAC AACTCAATGG GGTGGTAACG TTAGGCCACA 600
AAGGACATAG CCAGATGAGG CAGAACCGGA TCCTGATAGC ACAAAACAGA GAAGCTCGTC 660
GAACTAGCCG GGTCACTGGA TCTTAACCAA AAATCGGGCA TGCGTGTGTT TAGGACAATT 720
TGAAACACTC GGTTAAAACA TTATGCATCG CTTACCTTTA TATCCTGAGG TTTACTTATG 780
CGACTTTCGG TTGTGAAATG GTTAAATAAA GCGTATGGTT GATCCAGTGT TGTAATTGAG 840
TTGGTTGCTT TGTCTTCTGT GCCGTAAACA GTGCGCTGTA GTAGCGCCAC ACGGCGTCAG 900
ACGGAAGAAA CAGTATTCTA TGGCGTCATA GAGGCTTTCG ATACGGTGGG TGGGGTTAAT 960
AAATAAAAAC AACATTCTGT TCCATAGTTA ATAATATGAC ATTATCGTGT AGGACTGTGG 1020
AAAATATACA CGCATAAAAT ACAAACTACT TATTTTAAAA TTAAAACATA TCTAAGTAGC 1080
TTGTTCACTA AAAGAATCAT ACGGGGTTTC TTGACCCAAG GGCCTTTCTC AGGGGCAGTT 1140
CGTTTAGGTC GGTTTAAAAC ACGAAATTTA CTGCTGTTAA GGGGGTGTCT TTAAAGGACA 1200
TCTAATTTAG CAAATTTCAA ATAATCGAAC ATGTATAAAA CATGAGATTA GGAAAGAAAA 1260
TGTTGTTTAA GTTGTCTGGA AACAAAAAAA ATCTATAAAA TATAGTTTAC TTCAATTATA 1320
ATTTTCATAA TCAAGTATTT CTGCGTTGTC TGCGCGACTT TAGCTGTGTC TCATTTCAGA 1380
GACTGCATGC TTCGAAGAAC ACACACGAAG AGCATTTGCG TCATCGTGGC GCGACGAACG 1440
TTGGCTCAAG CAATCTCAAT TCTATCAAAT TTGAAGGCTA CTTCAAACAA ATACTGCTTC 1500
TGTTCTGAAA TGGGATCGCT TATTATGCCA CTGATCCTGT ACGTCATGAC GTTGGGCGGT 1560
GCGTGTGGGA CGTCGAGTCG TAGTGAGCAT CCGCATTGTT GTTGGTTGCA GGCGAGAATC 1620
ACATCAGACA GAAAACGACA CTGGTGTTGA ATAGCAATCA AACTGTGCGT TTTTCTGGTG 1680
TTTATCAGTA AAGTGTTACA GTCCTGGCGA TCGCTGCTGA TAAGCGTTTG CAGCATTACA 1740
GATTTATTCA TGCAAAACTA AATTATTGGC CCTCGGATGA GAACATTGTG TGCGGAATTA 1800
CGGCAGGCCA TCTAGCAATC GCTGTAGAAA GCTGCTTCTT TCTTTACACA ACAGATCAGA 1860
GGTAATATGA TCAATACATT ACTCACTTTT AGCTATTTGT AAGGAATCGC TTGTTTATTG 1920
CATGGGAATA TAAAACAACG ACAATGGACT GCTTGTGTTT ATGGCATGTG AGTCTGCCGA 1980
TCAGTATCCA ACATGATCCC CTGTAAATGT GTGCATGCAT AATCTACAAA TGTATTGAAT 2040
TATATGTTCT TAGCATGTAT GTCCTTAGCA TTCTTCTGTT TATGCTTCTG ATTAGCGAAG 2100
ATACTTCGAT AAAATACCTT AAAATGCTGA TACGCTGCCA TGGTAACCAG TGTTATTTTG 2160
TAATGTCATA ACATCTCAAT TATGACATTG GCTTGGCTTA TGGCTTGCTA TTATATAGAA 2220
AAAGCATTAG ACGTACTTGC CATAGGCATT CAAATATCAT GAAATTGCTG TCTAATACAA 2280
TAGTAAGAAT GCAAAATT 2298