EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-26127 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:20901410-20902470 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EOMESMA0800.1chr4:20901711-20901724AAGGTGTGAAACT+6.44
Foxd3MA0041.1chr4:20901555-20901567GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:20901559-20901571GTTTGTTTGTTT+6.32
LMX1BMA0703.2chr4:20902225-20902236TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr4:20902226-20902237TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr4:20902226-20902237TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr4:20902226-20902237TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr4:20902226-20902237TAATTAAATTA-6.62
RUNX3MA0684.1chr4:20901683-20901693AAACCGCAAA+6.02
TBR1MA0802.1chr4:20901712-20901722AGGTGTGAAA+6.02
TBX21MA0690.1chr4:20901711-20901721AAGGTGTGAA+6.02
TBX2MA0688.1chr4:20901711-20901722AAGGTGTGAAA+6.62
Enhancer Sequence
ATAATTAAAA ATAGGTATCT TTGACAATCA ATCAAGCTCA CAGGCGGAAC GCAGTGACGT 60
AAATTTTAGC GCGGGTCCAG GTCCAGGTGC GTTAATTATC TTTTACTTCC GTGAGACGCC 120
CAAACGGTTG AAGTTGAACT ATCTTGTTTG TTTGTTTGTT TTTTTCTTAA AAAATAAAGC 180
AAACTCTTGT TTTAATACAA GTTAGTGTAT AATATATTAA GCTTTTTATG TAAACAACAA 240
AAATACTACA AACGACTCGA CGTCCCTTGT GTTAAACCGC AAACGAAGTG AAGGATACTT 300
CAAGGTGTGA AACTGAGAGT TCACCTCAGT CAAACCCGCG GTGTTTTAGA CACAACAGCG 360
CCACCAGCCG GCTACGAGAA CAATTGCAGC ATCGAGGCGC GTTTGTTTGT CCGGGGTTTG 420
GCTCGTGAGA GCGGGTGGCT CGCGCTGACA GGTCCGCGAG AGGGACGGCC AGGAGTGACA 480
GCCGCTCTCG GGTCTCTGGG CGGACTAGAC ACCTCCTGGA GAGAGTAACC GGCCATTCAC 540
AGCAGGACTC CTTGTACAGC ATCTCGGCTC AGCTTTTACT CCATCCTCCG CTGCTGAAGC 600
AGGTGAGGCG GCTTTTGTGG AATTCACTGC CTGCCTGAAA GGTGACGATG CGAAATCACG 660
GGACTCACTG ACTTGCGGAC TGATTGTAAT ACCCCGACAA GGTATGTGAT TCTTCCTTTT 720
AATCTGTAAA GTTATTCTTT AAATGTAGCC CCCTGAATGG GCACTTTATT GTGAATGCTG 780
TATTTCAACT GTTGCCGGTG ATACACGCGC CGTCATTAAT TAAATTAGGT GCAATAGACT 840
TGTTTTGTAA AAGTGTTAAT TGTTTATGGA GGTAAAGCCG TTGTTTTTTG TCAAACTGCT 900
TTCTTATACT GTTGATAAAG TGATGCTGGA TGTTGTTCAC GCACATGAAG GATGCTGAGC 960
GATGCAACAA AACATGCTCT GATGCCGAAA GCATGTCGTG TTATCAGTTA AAACTGATCT 1020
AGTGTGCTTC ATTTTCTAAT AGCAAACAGA AGCATGACAG 1060