EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-26112 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:19707757-19709926 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr4:19709343-19709353GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr4:19709343-19709353GTCACGTGAC-6.02
NEUROD2MA0668.1chr4:19708903-19708913ACCATATGGC-6.02
NEUROD2MA0668.1chr4:19709245-19709255ACCATATGGC-6.02
POU4F1MA0790.1chr4:19709588-19709602CATTTATTATGCAC-6.08
POU4F2MA0683.1chr4:19709586-19709602CTCATTTATTATGCAC-7.91
POU4F3MA0791.1chr4:19709586-19709602CTCATTTATTATGCAC-6.96
SOX15MA1152.1chr4:19708050-19708060CTATTGTTTT+6.02
USF1MA0093.2chr4:19709343-19709354GTCACGTGACC+6.14
USF2MA0526.2chr4:19709339-19709355GCCAGTCACGTGACCG+6.03
USF2MA0526.2chr4:19709341-19709357CAGTCACGTGACCGCC-6.4
Enhancer Sequence
CTGTAAAAGC ATGTAAAACC ATTTTACAGT GTATAATTCA CCCGTTTGGA TTTATTATTC 60
AAGTTACAAG TTTTTTAAAA ATAGTCCGAT TTTCTTTATG TGAAAAGTCA ATTGCATTTT 120
TGAATGGAGA TTTAAAATAG TCGAATAAAA ATAATCAGAT CAGGCATTAT ATAGTCAATA 180
CACGCTGTCC GTCACATAAA CCTGAAAAAT GTGCTCAATA TCCTAACATG ACTGCTATAA 240
TACTGACATT TAAGGTGTAC TGTGTACGAA ATTAAATCTA GGCCTGTGGT TTTCTATTGT 300
TTTGTTCCCA AATAAAAAAA CGCAGATGCA TTCTAGAAAT GCTGGGTACA AAAGTAACGT 360
CTGAAAGTAT GCTAGGTATT ATCCTATAGC TATATGTGAT TATGTGATGT GGAGTAACTA 420
GGCCTACCTT TTAGCACAAT TACGTCTGAC TCAAATCTGG GGTGAAAAGG AGATCAGATC 480
TGCATGCATT CTTACATGGA CACGTAAGTG CTCTGTTTTA TTTTCCAAGG CACTTATAAA 540
CGACTAGTGA GCAAATTAGG CTAAACCCAA AAAGAAAGAT TTAAATGATC ATAAAAATGA 600
ATGACATACA AATAGGCTAT ATCACACTAC AGCTGTCCTC ACAGGTTAAG ATCTATGTAC 660
ATTTTTGTTA TGGACATCGG AATTGTGCAT ACACGTTTGC GCGTTTGGAG AGCTCAGTGT 720
GCACATTTAC GCAGGAGCAC AATAAGAGTT AAAGTGCTGT GATTCAGAGT TCAGAACGCA 780
AAGATTGATC GTTTAAGAGG CTTTTTTTGG ATTTCCGATG CCACAAGATT TCCTCATATA 840
TCAAAATCGA TTATAAACGT AGTTTACGTT TGAAACATTC CCAAAGTGCC CGAAAGATTT 900
GCGCACTGAT GCGTCACTTA TTACCCAATT TTTAAAGCAT TTAATCATTT TATTTACTCA 960
TTTCGTTTAT ATAAACGAGC AAAAACAACT TAAAGTGCTT TAAGGTGATA AATACATATA 1020
CTATTCGTCT CTTCATCCCG TTGGCAAGGT GACGATGGCG TTCAAAGCGG TCGTCGGGTT 1080
TATATGCGGA GCGTCCAGTC CTGCAGATAT TACTATGCTG TACGGGGTGG TTAATATGTA 1140
ATTTGCACCA TATGGCATTT TAAAAACCAA CCTTATTTCC ACAATCTTCG ATCTGTGTGG 1200
ATTTACCTAA TGATGCCCAA TTAGTCATTG AGCAGGACCA AGGATGAGGC TTGTGTGGAT 1260
ACTCTCTCGC TAATATTTGC TCTCCAAATA TTTCCTTTGA AACGTTTACA ACACATTTTA 1320
TCTGCTGGCC AGACAAGGGA CATCTGGGAG GGTTTTCAGC TCGCTATTTT TTATAAATAA 1380
AACCACAATT GGTTCACATT TGCCCCTCGG ACTCTATTTG TTCATGCTTG AAAGAAAATG 1440
TAATAAAAGG GGCACCATGA TGGATTTATG ATTTATCAAA AGCACTTTAC CATATGGCAG 1500
TCGTCTTTGG AGCAGGTTTT CAAATGTTTG CTTTAAAACA ACTAAATCTG ATTAACATGT 1560
AGCGAGGAAG GATGAAAGAT GCGCCAGTCA CGTGACCGCC GGACAGCCTC AGCCTCCAAT 1620
CTCCAGTTCT ACACAATCAC GGTGCTCGTG GCCTCATGAA AGACTTTAAT GTTTTCTAAT 1680
GTTTCTTTGG AAGCTGACTG ATTTCATATG TGAGCCTGTA TACCACTCCC AAATTCACAA 1740
CCTGCTAGGA CCTGTTCAGA GCTTTGTGGT GCTGAAATGA AGCTCAAACT TGCTGCACTA 1800
TTCGTTTTGG AAAGGGTGAT CGTTCAAAAC TCATTTATTA TGCACGGTTT GTTAACTGAA 1860
CTCAAATTCT CTATAGGTTA AATTAAAAAA TCTCCATTAC CTTCACAGAA TGTTAACTCC 1920
ATGTGCACAG GGAGCCTATT GAAACCGTTA TATCATCCTC TTAGTGTGCA CATAGTGTGC 1980
GAAATACACA GGAAATTTTT TGTCCGACTT CTGAAGTGAA TGGATTTTTT CACGTAGGTC 2040
TTAATAAGAT GCAAATCTTT TTAATCCAAA TACATTTGTA TGAATTATCT AAGTTTTTTA 2100
GAGCCACTGC CACAGTGCGT CAATCCAAAA GTTATTTTCA AATGAATAAC TATTATTAAG 2160
GGGTTGGAA 2169