EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-26088 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:18362681-18363043 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr4:18363018-18363039AAAACAAAAAAGAAAGGAAAC-6.01
RFX1MA0509.2chr4:18362847-18362863CGTTGTCATGGTAACA+7.63
RFX1MA0509.2chr4:18362847-18362863CGTTGTCATGGTAACA-7.6
RFX2MA0600.2chr4:18362847-18362863CGTTGTCATGGTAACA+7.08
RFX2MA0600.2chr4:18362847-18362863CGTTGTCATGGTAACA-7.17
RFX3MA0798.1chr4:18362847-18362863CGTTGTCATGGTAACA+6.69
RFX3MA0798.1chr4:18362847-18362863CGTTGTCATGGTAACA-7.21
RFX4MA0799.1chr4:18362847-18362863CGTTGTCATGGTAACA+6.58
RFX4MA0799.1chr4:18362847-18362863CGTTGTCATGGTAACA-7.18
RFX5MA0510.2chr4:18362847-18362863CGTTGTCATGGTAACA+6.7
RFX5MA0510.2chr4:18362847-18362863CGTTGTCATGGTAACA-6.84
Enhancer Sequence
AGAGGGTTAA TGTACTTTTA GTTCTGTTGT ATCCTACTGT TCATGGGCAT GAATGTTTTC 60
CTCCAGATCT CCAGTTTTTG ATGGCTCCAG TGACACTTTA GTGTTCCACA TTCCTCCCAG 120
TGAAACTAAA GGAAAAGTGA AAATGTGTGT TGTTACTGAA GATGACCGTT GTCATGGTAA 180
CAGCATCATC ACTTACAGTT CCCTGCCAAG CTGCACAGAA ATACAGCCAA AATACACCTG 240
GTACAGGTAA GATCATTTCA GACCACAGGC AAAGCCTTTT ATACAAAACA GCAAACATAT 300
TCTGAACTAT TTGTGTAGAG GTGAAAATAA AATTATAAAA ACAAAAAAGA AAGGAAACAG 360
CA 362