EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-26079 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:18157583-18158585 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr4:18158421-18158440TGGCGACACCTACTGGCCA-7.26
LMX1BMA0703.2chr4:18158300-18158311ATTTTAATTAA+6.62
NFIL3MA0025.1chr4:18158442-18158453TTATGTAACCT+6.14
NFIL3MA0025.1chr4:18157906-18157917TTATGTAACAT+6.32
SREBF1MA0595.1chr4:18157838-18157848ATCACCCCAC+6.02
Enhancer Sequence
AACAGATGAC AGCACCAGAG GCACGATGTG ACAGACATTT GAAAGGGGAA TGTTTGTAAT 60
GAGAGTTGCT ATGTTTTTTT ACACATCCTT TTTTCCTCCA CCGAGAGCTT CTAACGTTAC 120
CGTCAACAGC ACAGACCGAC CTGCACGTCA CAAACAAACA CGTGTCACCG CACATCACGC 180
ACCCTCAGCG ATATAATAAA AAAATCCAAT TTAAATAAAA ATTACACTGT CTGGAGACAG 240
TCATAAGCAT AACACATCAC CCCACACACT GGGAAATGTG CCAATTTTAG CATTCTAGCG 300
AGAGAGATGT ATATATACTG ATATTATGTA ACATCCAAAC ATCAGCACGG CTATAACGTT 360
AGTCTACAGC TGTGTTGGTA TTATTGAGGG AATAAAAGCA CTATTTTGAG CGTGGTGTTG 420
CTCTTATTGG TTACTGTTCA GTAAACAATA TGTTAATGTC GAGCAACTTA CATTTTAGAA 480
ACAACGTTGC TTCTTTTGTC TGTTTGTGAT GTGACACGTT GTGGTTCCAA ACAAAGCCAC 540
GTGAGAATCG GTGAGTTAGG GAAGTGATTC AGTTGCTGAA TCAGGAGAGT CGGTTGAACG 600
AATGATTCAA TACATCAAAT CATTTGATTT GTTTGAAATT TTTGTTGGAA ATATTGGTTT 660
GAATAATCGT TTGAATTAGC AATTTTAACA GATCTGATGA ATGCGCGATT TCGTGACATT 720
TTAATTAATT TAATTGCTGG ATAAATGTTT GAAAGAATCG GCTCACTAAA GACCGTTCCC 780
GAATGAATCG CTGGTTTGAA AAACTCGGTT TTGAATCGCA TACATATTCA CAAAAAGCTG 840
GCGACACCTA CTGGCCAAAT TATGTAACCT GCTTAAGAAA GTGGAATAAC TGAAATATTT 900
ATATTATTTA ATTTATTCAT TTTCATTTAG CTTATCTCTT TATCAGGGAT CACCACAGCG 960
CAATGAACCA CCAACTATGC AGTCATATGG TTTACACAGC AG 1002