EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-26018 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:15207810-15209113 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr4:15209004-15209016TTTGTTTACATT-6.37
FOXK2MA1103.1chr4:15209004-15209015TTTGTTTACAT-6.32
FOXP2MA0593.1chr4:15209004-15209015TTTGTTTACAT-6.14
Foxj3MA0851.1chr4:15209001-15209018GACTTTGTTTACATTCT-7.28
HNF1AMA0046.2chr4:15207892-15207907TATTAATAATTAATT-6
Lhx3MA0135.1chr4:15207895-15207908TAATAATTAATTT-6.25
POU4F1MA0790.1chr4:15207893-15207907ATTAATAATTAATT+6.36
Enhancer Sequence
ATTTTAAAGA GATGACACAT CAGCCTTCAG CTAATAGATA TATACCTTCA GTCATTTTCA 60
TTCAGGATTT AAACAAATAC ATTATTAATA ATTAATTTTA TTTAAAAATG GGAGCTTTCT 120
GGACACCCAA GGTTGCCTTA CAACAAACAT TAACAGACAT ACTAAAACAA ATGAATAAAA 180
CAATCAATAA AAAATAAAAC AATGCCAGAC AACATTCAAA TACATGAGAG GAATTAAAGT 240
ACAAACACAT CAAAGTAATA AAATAACATG GTAAATGATA ATCATTGGAA AGCCTGCATA 300
AAAAGACGGG TATTAGGACA AGATTTAAAA ATGTGAAGAT TATCCCTGCT CCTTAGGCCC 360
AGGGGAAGAG AGTTCCATAG CCGAGGAGCC AAATCTGTCC TCCGTATCGC CATTCCTGGT 420
TTACTATAAA ACACAGATGC AAAAAACAAA ACATATAAAC AACACAGAAC TGTTTTAAAC 480
ACATCCATTT AATGAAATAA AACAAACACA TCTACAATAA CTGACTAAAA GACACAACCG 540
TTTATTCTCT ACTCTCTGTT TGTTTGTTGA CCATGTGCTT TCCAGTTCAA CACAATATTT 600
AATCAGTCTT ACCACAACAC TCGAGAGATA ATGCTTCATT TTTAGAAACT GGTAGATATA 660
TGCTGCTGGT GGATATGGCG TCGATAAAAT CAGCGTTGTT TTTGTAAAAA TATACGAGGT 720
TTAAATCTCA GATCTCTTCA CCTGCGGCTA ACGCGAGAAA CTAGACACTG AAGTGCAGTT 780
TTTCCTCCGC TCCTCTAGGC GGCGTAACCG TATTCACGTT CAGAGCTTCT GAATGACAAC 840
ATTCCGTTGC AAAACAGGAA ACCACGTGCA GACCGTTTTA CACACAGATG CTGCAGATGA 900
CAGCTCACTA ACAGTGTTTT AAAAACAACA AACAGCACGT TTCCCAGCTT ATCGACACAT 960
AATAAGGACG CACTATGTGA TAAAGAGTGT CTGGAGTGTC AAACGACTCA CCTGTAAGCA 1020
TAATTCTTCT TATTGCTTTT GTATGTTGCT CCTTTAGTCA CTGTTTACTT TATCTGTAAG 1080
TCATCATATC GATGGTGTTT TACTCTAAAA CCTTGTTGTT TAAAAGGACT GCTTGATATT 1140
TGTCAGTTAA GCACATTTGT TGGCAGTTTT ATCTTCTGTG AGGGTTTATT AGACTTTGTT 1200
TACATTCTGT TGTATTGGTA AACTCACTGA CACACCTCTA AAAGCAGTTA TTCAGCTTCT 1260
GATGTTGATA TTGCAAAGCA AGAATGTTGT GTTATTTGTT GTT 1303