EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25965 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:13490653-13491810 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRTA2MA1478.1chr4:13490814-13490826AATGTAACAACT-6.04
Foxd3MA0041.1chr4:13490662-13490674AAACAAACAAAC-6.32
ONECUT1MA0679.1chr4:13491349-13491363GTTATTGATTTATT-6.03
ONECUT2MA0756.1chr4:13491349-13491363GTTATTGATTTATT-6.17
ONECUT3MA0757.1chr4:13491349-13491363GTTATTGATTTATT-6.49
Enhancer Sequence
ATTGGTAGCA AACAAACAAA CAAATTCACA ACTCATCAAA TCACATTGCT TCTCCATAAA 60
TTAATATACT TATGCTTTAA TTTTGTCAAA AACGTTCATG ACATCATACA ATAGCGTTTC 120
CCTAGCATAA TTATACTGTA ATGTTAAAAA TCAAATGTTG TAATGTAACA ACTAAATGTT 180
ACAAAGTTAT TCAAATGCCT GGTGTCTTTA GTAGTGTAAC TTACGTTAGC TGGCCTCCTC 240
AGAAAGACCG CCAAATGCCG TCAGGTCTGC TTCTGGGATT CTGGTGGCTT AAAGGCGCCT 300
GTCTAAAACA GCAGTTTTGC TATTAAAATT ACACCAAAGT CATCCAGCAT GTGTAAACAC 360
CAAAATCACT AACAACGCAG TCGACATTAA AGTGATTTTA TAAAAGTATT TACCGTCGGC 420
GAACTCCACA TTTCATCCGC TGCCAAATCA CGACGCCAAA ATCTCCGCCG CCGATGCCGC 480
CAAAACATAG CTGACGTCAT ATCATCAATG CAGTAAGTTG GTTTTATTTG TTGTTTTCTT 540
TTTGAATTTT TACATTTGTG GTAAGAATAT CACCACCATT CTCGTAAATT ATGCTTGTAG 600
GCATAGTGCT TGTTTAGGCT CTTTCATTTA AATTTTTAGA AGCACAGTGT AATAGAAACC 660
CCGATTTCTG TTGTTTTTAT GTTGTCAATT TTTTATGTTA TTGATTTATT ATTTTTTTTA 720
CTTGACAATA GGCCTAGTTC ATATCCGTTT TGGTTTCAAT GTTATCCACT GGGTGGCGAT 780
ATGTCGCCAT TTATCAGTAG GCTATGATTG AGTAGGTTGC TGTTATTTTG AAACGCCATA 840
ATTTTGTACA TTTTTGCAAT AACATAATTC TTAAGTATTG TATTTCAATT TGTATTATTT 900
GCATTTCTTT AAACGTATCA TTCTGTACAC ATGGTCAATG TGAAGATGCT AAATTGACAT 960
TCCACATTTG ATAACCAAGC ACTGCAGACA GACTTCATTA AATATGTGTA GCGAAGCACT 1020
GTTTCTTGTC AGTGGTCCAG TCCTTACTCA GTAGAAAAGT GTGTTCGTGG AAATACCCTC 1080
ACCTCCTCCC TAAGCTCAGT ATCCTTATTT CAGCTAAACC ATAGCCTAGT AATTCTGAAG 1140
TCTTGAAAAA GTTTTCT 1157