EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25959 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:13008746-13010145 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr4:13009546-13009558TTTATTTACTTA-6.07
FOXC2MA0846.1chr4:13009542-13009554TTTGTTTATTTA-6.18
Foxj3MA0851.1chr4:13009105-13009122GTATTTATTTACCTTCA-6.05
Lhx3MA0135.1chr4:13008843-13008856AAATTAATTAATG+6.54
MEOX2MA0706.1chr4:13009568-13009578GTTAATTACT-6.02
POU2F2MA0507.1chr4:13009982-13009995TTCATTTGCATTT+6.59
POU6F1MA0628.1chr4:13008845-13008855ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:13008845-13008855ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
TAAAACAAAC GCACTACATA GACATTTTAG CTTAAGTCTA AGCAATTTTA TATTACTTTT 60
TTATAGACAA TAAAACAATT AAATAATAAA ATAAACTAAA TTAATTAATG ATAACATTTT 120
ACATTATTAA CTTAAACTTT TATATATCAT CTGTTAAATA GAACTTAGTG AAATAATGAT 180
GTGTGTGAAT GATGTTCTTG AAAAGCTGGT TTGCAAACAG ACAGAAGTGC TCAAAACACC 240
ACATGCTGGT GGCAGAAGTG TTCAACATCT CTCCCTCCCT CTCTCTCAAT AGACGAGCCC 300
CAGTCAAGAT TATTGCTACA AGTTGCCGCT TTGAGTCAGT CGAAAGCGAT TAAAGAAATG 360
TATTTATTTA CCTTCATTTC AAAATAACGA AAAATAAATA AACTAATAAA ACAGAACAAT 420
GTTTATGTGG GTACAACAAA TCAATCACAA CACTCCAACA ATAATCAAAC CACCCAGAAG 480
GAGTGTTGAA GATCTTGTGT CTCGTGTTGT TTGTCTGTGT TTGTCCAGAT GACTCTAAAC 540
ACTGGCCATT TAGCGACCTC CATTACTCCA GTTCCTCTGA GAGCTCATTA CTGAACCAAT 600
ATTTCACCGA TAGTTTCTAC GTTCATTTAG TTATTCAGAT GCTCGATTCG TTCAGAAATA 660
AAGAAATAAT TGGTGCACAC TCACCTGCAG CAGAGCAAAG CAGACATCCA CTTCTGCTTG 720
AAGATTGATT GATACACTTG ATGACCACAA GAGGGACCCT GCAGATACAA TGAGTGATAG 780
AATGTTCGCT TGTTTATTTG TTTATTTACT TACTTTAAAG GTGTTAATTA CTAAACACAT 840
TCAGTAATAT GCAAGAGGGT CTATTTAAGC TACATATTTT ATGACATTGA ATAAATATCT 900
GGAAGTCATT TTCAGTCTGT CCTGTAGAAA GTGTGCCGCT CCGCTAGAGG CGCAAGAGAC 960
CTCACGTTCA GCACGAGGCT CACCTTTTGC TCTGTGTAAA CAACATGACG CTTGACCACA 1020
GTCAAAACAA AGCTTTCTGA CCGTTTTCAA GATATAAAAG TAAATTTCCT GCAGGTGACA 1080
GTCAGTGAGA GCATTTAAAT GTCACTTATC AGCACACATT TCAGCCCTTC CGGCAAAAGC 1140
ATGCGACTAT CTCTGGATGA TGTGCAGAAA TGCTGGACAC TCCATCACCT GTAAGTAACT 1200
CTACACTTCT GTCGTTAAAG GATTATAAAG CAATGCTTCA TTTGCATTTA ATCGTTAATG 1260
ACGTTTATAT TGAGGTGATT CCTGTCAAGT TTATCATGTA GAATAATAAT ATTCATCAGT 1320
AGTGTTGTTT GTTTTTGCAT GCAGTCTAAT GAATTCATGT CTGATATCTT TATTTTTTGA 1380
GCTTCTGGTT ATGATTCAT 1399