EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25940 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:12064753-12065998 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr4:12065620-12065631TTATTTACATA-6.02
FOXP1MA0481.2chr4:12065484-12065496CTCTGTTTACAT-6.32
FOXP2MA0593.1chr4:12065485-12065496TCTGTTTACAT-6.02
Foxd3MA0041.1chr4:12064833-12064845GTTTGTTTGTTT+6.32
POU1F1MA0784.1chr4:12065619-12065633CTTATTTACATATT-6.13
Enhancer Sequence
AACACAGACC TATAATGAAA TAAAACAAAC AAATCAACAA TAACCGACTC AAAAACACAA 60
CCGTTTGTCC TCCACCTTGT GTTTGTTTGT TTGTTGACCA TGTGCTTTCG AGTTCAACAC 120
AATATTTTAT CAGTCTTACC GCAACACTCG AAAGATAATG TTTCATTTCC AAAAACTAGT 180
AGATATATGC TGCTTGTAGA TGTGGCGTTT AATAAATCAG CGTTGTTTTT TGTAAGAATA 240
CACGACGTTA AAATCTCAGA CCTCTCCACC TGCAGCGACC ACGAGCAACT AGTCACTGAA 300
GCGTAGTTTT TCCTCCGCAC CTCTAGGTGG CGTTACCGAA GTCACGTGCA GAGCTTCTGA 360
ATGACAACAT TCTGTTGGGA AAACAGGAAA ACATGTCTAG ACCGTTTTAC ACACAGATGC 420
TGCAGATGAC AGCTCACTTA CAGTGGTTTA AAAACAATAA ACAACACGTT TTCCAGCTTA 480
TCAACACACA ATAAGGACGC ACAATGTGAT AAAGAGTGTC TGGAGTGTCA AACGACTCAC 540
CTGTAAGTGT CTGTTTTCAT TCCTATTGCT TTTGTATGGT GCTCCTTCAG TCACTGTTGT 600
TGTTTTTTAC CTGGAGGTCA GCGTTTTGAT GGTGTCGTTA CTCTAAAACC TTGTTATTTT 660
AAAAGGACTG TTTGATATTT GTCAGTTAAG CATATTTGTT GGCAGTTTCG TCTTCTGTGA 720
AGGTTTTTGG ACTCTGTTTA CATTCTGTTG TTTAGGTGAA CTGACATACC TTTAAAAGCA 780
GTTATTTGTC TTCTGATACT GATATGTTGT GTTATATGTT GTTGCAGTCC TAAAGTTGCT 840
AATAATGCTC TTTTAATTGC AAATGGCTTA TTTACATATT TGTTGTGGTG TTGATTTCAC 900
TTGGGGCCTT CTCTTGATCC AAATTGAGTA AATATTTAAG CTCAAATATT TATTTTTTTC 960
AGCATTCAAG CTGAGGGAAG AAAGGTTTTG TTGTTGTTGC TGTTGTTTGA ATAGGTTGTT 1020
GTTTAAACGT GTAGTTACAT GTTGTGTCAT CAGAAGTAGA CTGAGAAAAA GATCAACATG 1080
AATAAATAAA ATAAAAGGTT TATTGTTGAT ACAGCATTAC TGAAGTATAA TGTGACCATG 1140
GACCACTAAA CCAGTCTTAA ATGACATGTG TAATGGCTAT TTGGCTATTT TTTATTAGTA 1200
AAATGCATGG CTAAGCACCT TTAAGGCTCA GATTCCAGAT ATTCA 1245