EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25903 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:10131218-10132198 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GSX1MA0892.1chr4:10132015-10132025CCTAATTAAA+6.02
HOXA13MA0650.2chr4:10131778-10131789GTTGTATTGGG-6.62
HOXB13MA0901.2chr4:10131778-10131789GTTGTATTGGG-6.62
HOXD13MA0909.2chr4:10131778-10131789GTTGTATTGGG-6.62
POU4F2MA0683.1chr4:10132016-10132032CTAATTAAATATTTAA-6.28
Enhancer Sequence
CTGAGCCGCT AGAGGGCGAC CACACACCAC TGGGCTTCCC AGCTGCAGCT AATGAGGTGT 60
TATTAGTTAC TCCATCAATA CAAGCTGGTC AGGAGAAAAG CTCCGTCAGG TCAGTGTTTG 120
AACAGTAATA TTGATTTAAA ATAGCAGTAA TTTAAGGGTA TCTCTGATAA ATCGATGAAA 180
ATCGCTTAAA AATAGCACTG GTTTCACAAT GATATAGAGA AAGTCGAGAT TTCCGTCAGA 240
TCTCTTCATT TACTCAATAA AAGTTGCTCA CTGGGTGAAA ACATGTCTAA ATAAAAATTA 300
AATCATCTTC AAACTCAGAT TATATGCCTC AATAAACTTC AGAAATGTTA TTTTTGAGGC 360
TTGAAATGTG TACTGGAGTA TAAATGCTCA TTACCAAACG CATTTCTTTC CAGTTTATTG 420
AACAAAAACG AAACATACAT CTTTATTTTT TATGATTGTG ATCTTTATGC CACATACATA 480
CAAAAAAAGT GATATTCTTT GGTTTATGAA TCCAATCAGT TCAGACAAGT GTGCTATTTT 540
ACAAGAGACA TCAATATTGT GTTGTATTGG GTAACTTACG CACTTTATAT CAGATATTCT 600
GCTCATCTAT CAAAGTGTCC TAACAAATAT GAAAAATATG TAATATTTCA GTTGTATTGA 660
CTTCCATACT GTTTAATTGT GATTGATGGC CATTTATTTG GTGCAGGAAT CAGATGCTTG 720
GAAGGAAGAG GAACGCGCGG AACCATTATC TACTTCCTTT GGACAGTTTG GCTGAGTAAG 780
ATTGCTCTTT TGCCTGGCCT AATTAAATAT TTAATTCAAT TAGGTTAATC ATAGTTATCT 840
AAAGGTTTCT TATATATTTT ATAAGTGATG CTACACTGTA ATTTTTGTCA TATCTAAGCA 900
CGTTTTTTTT TTAAATGAGG CCAAATCATT CCGAGCGCCT CTGGTGGCCG GCTGCAGCAA 960
AGAGCTTAGA ATGACCAAGA 980