EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25899 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:10012673-10013761 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr4:10013732-10013749TTCATTAATTAATTAAT-6.09
ArxMA0874.1chr4:10013731-10013748ATTCATTAATTAATTAA+6.41
FOXE1MA1487.1chr4:10012748-10012763CTTGTTTATTTTAGC-6.13
Lhx3MA0135.1chr4:10013734-10013747CATTAATTAATTA-6.46
Lhx3MA0135.1chr4:10013737-10013750TAATTAATTAATC+7.34
POU6F1MA0628.1chr4:10013735-10013745ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:10013739-10013749ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:10013735-10013745ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr4:10013739-10013749ATTAATTAAT-6.02
ZNF24MA1124.1chr4:10013718-10013731TACTCATTCATTC+6.29
ZNF24MA1124.1chr4:10013726-10013739CATTCATTCATTA+7.12
ZNF24MA1124.1chr4:10013722-10013735CATTCATTCATTC+7.82
Enhancer Sequence
ATAGTTTGCA GTGCAACCAA ACATTTATTT TACTCAAACA TGTGTAAACC CAGAGAAACT 60
GAATAACAAA GTGATCTTGT TTATTTTAGC ATATATTTAG GCTACACCAG ATGGTTTATT 120
TCGGTATTTA TCAATTAACT TACAAAATGA CCACCAATTT TACTTACCTT TTCTGTTAAT 180
GACTGGAACG TGCGCAAACT ATTCACACAT TGGCGTTACT TGGAAATGTT TGCATATAAA 240
TTAGCCCCTT TCAGATCCTA TTGATATTCA AAGTCTTAAT TAAACATAAT CTAGGAGTAT 300
ATATACGGTA ACTCGTCGAT TAGCCTTCAT TTATAGCAGC TACAAAGTTG TCTTTGTTCG 360
TTTGTTGACT TTGACCTCAT AATGGTGTTT TGCTGTGTTT ATATAATATA GGGAGAGAAA 420
ATGATCGAAC TGGAACTCAA ATAAACATTA CGTAAATGGG CCAGCTGTCT AAGTATGAAA 480
CTTTAACACT AAAAACCGAA CCAGTCATCA GTTTCGTGCT TTTCCGCTCA TCATTGTTTG 540
GCGTGTCATT TGAGGGGAAC GTTTTTGGCC TTGTTTCAGC AGTGATTCAG TTTCCTCCTT 600
GGACCATTCG GTTGCCAGGC AACGCCATCA GGTTTCTGTG ACAGAGAGTG GCAGCTCTTC 660
GCGCTTTTTT TCCTCGTGCT GACACGGATC TCCTACAATC TGAATATTTT AGGCAAAACA 720
AAGATACTGA GCTCCTGCAA ATGGCGAAAT GTCTCTCAGC CAGCTGTTGT TTGTTAATGA 780
CGGAAGTAAA CGCCATTTCC TTGTTGTGGT ATTTGGTTAA AGCAATGACC ACTGCGTATA 840
TACAATATGT ACTCTAAGGT TACAATGAGT CAATAAACTA CAGGTGAGTT TACCATTTTG 900
ACTTATATGT TAGCTTGTTG TCCCCTTACT AGTGTTTTAC AAAATAAATG GTCCCTAATG 960
TGTGTGTAGT ATTGTAATGT TTGTGTTTTG TGGCTGAAAA TGCTGTTGCA AACGTATACA 1020
TTCATACATT TCTACCGCGT AAGTGTACTC ATTCATTCAT TCATTAATTA ATTAATCAAT 1080
TCATTCAT 1088