EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25884 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:9629373-9630555 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC1MA0032.2chr4:9629533-9629544ATGTTTACTTA-6.02
FOXC2MA0846.1chr4:9629532-9629544TATGTTTACTTA-6.27
Foxd3MA0041.1chr4:9629592-9629604AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:9629596-9629608AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:9629600-9629612AAACAAACAAAC-6.32
Enhancer Sequence
CAAGAGAATA TCATCTAGAG CAGCAATAGA GCATCATGTC AGAAAAGTCT GTGATAAACC 60
TCCATGAAGG ACCAGACTGC ATTAATACAT GCTCATGTTG TCAAATAAAA GAAACATTGT 120
AAAAATAACC TCATTAAAAT GACAATATTG TGACTTACAT ATGTTTACTT AAATAAACTG 180
ACCTGCCCAG CCAAGAGAGT TCAGAAGAAA CATTCATCCA AACAAACAAA CAAACAAACA 240
ATATGAACGT TACTTACAGG TCACTGTATT GTCACTGTGT TCCTGCACTT TACGGTTCGG 300
GTTGTTTATG TGCTGTTTAG AGATATTATA ATGAAATCAT GGAGCTGTCA GGGTTTGTGT 360
TTATCATTTG TATCATTAAG CCTCATGCTG TCAAACACCT GAAGCTGCGG GTCAGACTGA 420
ACGTAAAGCA ATGCGCGCCG CCTAGTGGAG CGGATGGAGA ACTGCGCTAC AGTTTATAAC 480
ACACGAGTCG TGTTGTAGGT TAAACACGCT TAAAATTATT ATTTTAATAG TTTAATGTCA 540
AATTCCAATC ACTGACTCAG AAGGCTTTGA GGATGCAGTT TAAAACATGT TCACCCTCAA 600
GAAAAAGTGT CTAATAAACT TGTGAATAGG TGTTCCTCAG CTCCCTCCTG TGGTCAATAG 660
GTGTATCCGC ATTAATGAAA TAAACACGCA CAGGGTGGAC GCACAGTCAG TCGAGTGAAC 720
ACTGAATACA GATTAAGGGG ATTTCTATGA TATTCCAGGA TATTTTACAA CACATTTGAC 780
TTTGTGATTG TCTCGGCCAG CAGAAGATCG AGATCAGCTT TAACCTGATG GAGTAAAACA 840
GGTGAACTGG AAAGCTCATG TAAACACTGG CAGATATGAA TGGACAATCC TCCGAGACTC 900
TGGGTAAAGT AGATGCGCGT TTGACTTGAT TTATTTACAT GCACGTGCGC CGCTGTTGTT 960
CACAGTTAAA GTGTTTTGCT GTGTCTTGTT TGCAGAATCA AACAGCGTTT ATATCAATAC 1020
TGCTGGAGTC TGCAAACAAT TCCAGAGCAG CAGGATTTTG TGCTTTTACC ATCCAGTTAC 1080
CACCACACCA ATCCCTTATA GAAATCTGAC ATGGCAATGC ATGAAAATGA CACATATGAC 1140
ATTCAAGATC ATGTTAAAAT TTCACATATA TAAAATATCA CA 1182