EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25879 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:9394787-9395837 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF3MA0605.2chr4:9395521-9395533GATGACGTCATG-6.37
ATF3MA0605.2chr4:9395521-9395533GATGACGTCATG+6.44
ATF7MA0834.1chr4:9395520-9395534CGATGACGTCATGT+6.03
ATF7MA0834.1chr4:9395520-9395534CGATGACGTCATGT-6.28
Arid3bMA0601.1chr4:9395816-9395827TTAATTAATAT-6.62
Creb5MA0840.1chr4:9395521-9395533GATGACGTCATG-6.22
JDP2(var.2)MA0656.1chr4:9395521-9395533GATGACGTCATG+6.27
JDP2(var.2)MA0656.1chr4:9395521-9395533GATGACGTCATG-6.74
JUNB(var.2)MA1140.2chr4:9395521-9395533GATGACGTCATG+6.44
JUNB(var.2)MA1140.2chr4:9395521-9395533GATGACGTCATG-6.52
LMX1BMA0703.2chr4:9395813-9395824GTTTTAATTAA+6.14
SCRT1MA0743.1chr4:9395335-9395350AAACACTTGTTGCGC-6
Enhancer Sequence
ATACGTAAGA CAGACTTTAT GTGTAGTCAT TTATTTCTGT TTATTTGATG ACTAATCTAG 60
TTTTGGCCAA TTCTAAGACG TCTATTAGAT TTTCACTGAC AGCCCAAATT TAGCCTTGTT 120
TTAGCCAAGA CGACTATGTT TAGATGTCTG TTGGACATCT TTTAAAAACA TTAAATGCTT 180
GCTGGGATTT GTGTGTGTAA TTATGTAGCA TATCTGTTTG TGAGTTTGTT TGTATGTGCA 240
TTTGTGCATG CATATTTACC CTATGCTTTA TAATGTATTA AATGTGATTC TCATAAGGAG 300
CAATTGAAAA TGCTTATTTT CTCGACTTTT GCACGTTTAG CATCCATAGT CTGCATCCAT 360
AAAGCGCACA GCAGCCAAAC AGACACACCG CCCTTAAAAC GCAACGCTCA TCCCGCGACG 420
TCATTCAGAC GCATGACCAT AAAATCGCAG ACGGAGTTCA AGAACATGAG CGTCAAGTTC 480
AAGTAAGAAC GTCAAATCCG CGTTCACGCT CAGCCTCGCG CAGTTGTTGA CACACAAACA 540
ATGCAAGCAA ACACTTGTTG CGCAGTTCAA ATACAACAGC TGTATGAAGT TACTTTTTTC 600
TCCCAAAGTA AATACGCAAC AAAAAGTGCC GAGGAAGGGT GAAACTGAAC AGAGCTGTAG 660
GAGTTTCAGA CAGTCTGAGA TAAGCTCGCG TGTTTTGACT CCAGATCCAG AGCGCGGGGC 720
GTTTCTCCGC CGTCGATGAC GTCATGTTCC ATATGGCGCG CGCGCCGCTC CGCAGCATCG 780
CGCGCGCGCG GCTGATCCAC GTTCACACCG GTAAATGCAC CGAGAGCGCG GCCGACGAGG 840
ACTTTGTGTC TTATAGACGG AAAGGAGGCG CTGTGTATTT ATAGCAGGGC AATTAACAGC 900
CTACTCTGCG CGTCATATTT TAGCTCTCTT ATTTTTGGAT CAGCCAGACT CTTCCTGCTC 960
TCGGATGCTT CTTTATAAAT CATTGCCTGG GTCTTCAGTG CATGGAAATC ATGGAACTTT 1020
AGGACTGTTT TAATTAATAT TTTTAGAGTG 1050