EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25869 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:8734087-8735541 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFLMA1102.1chr4:8734805-8734819CGCGCCCCCTAGTG-6.04
HOXD9MA0913.2chr4:8734409-8734419GCAATAAAAC+6.02
ONECUT3MA0757.1chr4:8734216-8734230AATATTGATTATTC-6.06
ZNF384MA1125.1chr4:8735513-8735525TTTTTTTTTAAA-7.22
Enhancer Sequence
GTTTCAGCTT CTGGTTAACG GGACACTGAA ATAATTCAAT AAAAAGATTT ATTAAAGAGA 60
CTCGCATTGG CCCAACTGTT CAGTTCAACT ATACGCTCCA CCTGATATTA AACTATAGAA 120
CTATGTACAA ATATTGATTA TTCAGCTTTT ACAGCCCAAA TAATACAGAA TATACTATAA 180
ATTATAAAAA GATAATAATA GTAATTATAA AATGTATATT GATAGTGACA AACATATTTA 240
AAAACGTTTA ATATATAAAA TAATTCATTA TAAAATCAAC ACAGCACTAG TTCAGCATGA 300
GAGCATCATG TCATGAAAGT CTGCAATAAA ACCAATTAAA TTAAGGAAGA CAGTCATAAT 360
GCTCAATAAA TAAAACATTT TAAGCACAAC TCTGATAAGA TTAGAACAGT GTGACTTTTA 420
TATGTTTATG TTGAGCTAAA CTGACATGTC CTGCTTTGGG AAACGACATA AAAATCAAAC 480
GTCAACACAA ACAATACGGA GAAAACACGG TAAAGTTACT TACAGGTGCG TCTCTTGTCA 540
CTGTATTCCT GCACTTTACA GCGCGGCGTG TCTGTTCAGT TTGTTTGTGT GTTGTTTATA 600
GATATTATAA TACAATCACG GAGCTGTCAG GATTTGTTTA ACGTGTTGTA TCGTCAAGCC 660
TCATGCTGTC AGTGTCAAAC ACCTTAGAGC TGCGAGACAG ACATAACGTG AAGCAGTGCG 720
CGCCCCCTAG TGGGGCGGAT GGAGAACTGC GCTACAATTT ACAACATAAA GTCCGCGTTG 780
TAGGCTTAAA CAGACTTAAA ATGATTATTT TTATAGTTTA ATGTCGTATT ACAAGCACAA 840
TAATTAATTC TGACTGCATT GTCTAATTAT TATACTCAAG AAAACGTGAC TAATCAACTC 900
GTGTATGGGT GATCTTCAGC TCCGGCTTGT GGTCAATAGG TGTATCCGCA TTAAGGAAGT 960
AAACACAAGG TGGACGCGCA GTCAGTCGTG TGAACAGCGA AGAGAGATTT AAGAGATTTT 1020
AAATATACTC GAGTATATAA AATATACTCA TTTATTATTG AGAGTGTATC GACCGGCAGA 1080
AGATCGAGAT CAGCTTTAAA CTGATGGATT AAAAGAGCTG AACTGAGAAG CTCATGGAAA 1140
CACACTCAGG AATGAATGGG CAATCCTCCG AGACTCTGGG TAAAGAAGAT GTGCGCTTGA 1200
CTTTATTTAT TATTTACATG CACGAGCCTC TTTTATTCTT TATTCTATTC TTTTATTCTA 1260
AAGTGTTTTT CTGTGTCTTG TTTGCAGATT TCAGCAGCTT TTATTTCAAT ACTGCTGGAA 1320
TCTGCAAACT AATCTAGTAG GACTTCAGGT TTACCATCCA GTTACCACCA ATACAATATT 1380
GCAAGTTCAG GTTTGTATTT CACACATTTG TCATATATAC AACATGTTTT TTTTTAAATG 1440
GCTGTTTACA AATA 1454