EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25859 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:8710830-8712376 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFYAMA0060.3chr4:8711893-8711904AACCAATCAGA+6.62
POU4F1MA0790.1chr4:8711984-8711998CTACATAATTAATT+6.04
ZNF384MA1125.1chr4:8711252-8711264ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr4:8711251-8711263AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
TGCTAATATG ATTTCACCAT TTTGAATGTG CAAATAAAAC TTCTCAGAGA TTATATTATT 60
AAGGAGAAAG TCTGAATGTG TGAATATAAA TCCAGCTTTA CATCAATCAT GAAAAGGCGA 120
GTTTGGAGAT CTTTTCTGCT TTTAGGATAC TGTTGTGAAA CAAAAAACAA AACAAAAAAA 180
ATTAAAAAAA TAATAATAGT TATCTTACAT ATACCGTATA GGAACAGCAT AGCAGAACAT 240
TTTGGGTGGT TTAAAAACCT TGACTTTTCC AAAGCCAGGT AAACCTGAAA ACGGTTACGA 300
TGCCTACTTC CAAGTCTGAT TTTGAAAGAA ACCCATAACC TCAGATTATT CATTTTAAAA 360
CACACATTAC ACTTTTATGT TGACAATATC TTTGTGTACT ATTTATGTAG CTACTTAAAA 420
AAATAAAAAA AAAATTCTTA ACAGTAAATA CATATTAATT CAATTCGATT ACTAGTCTGC 480
AGCATGTGTT TTAGGGATCA TAAAGTATTT TGTTTTACAT AATAATATAT AAATATTTTA 540
GTTTACCACA AAGATTAATC ACCATCATTT TTTCTTTTCT CTGTTTCAGT GATGAAGAAG 600
ATGTAAAGCT CTGGGTCTAT GGATGGTTCA AGATGGATGA GTCAATGACA AACACTCCTT 660
TTCCAACACA GTTCAAACCA CAGCCAAACT TCAGAGGGTC TGATCCTTCA TCATGCACTT 720
ATAGTAAAGC TTGATTGGTT ATTTGGGCAG ATTTGAATGA ATGATCATTA ATTTCTGTGT 780
GAGCTGATGA CTAAATACAG TTTATCAAAT AACAGATGCG CAAGGTCAGA TCAGTGCGTT 840
ACAATTTAGT TATTTAGTTC ACAACAACAA TCTCACCTGC CCTTGGGCTC TATTTTAACA 900
ATCTAGGAGC AAAGTCTGAA GCGCAAGGTG CAAACGCATT AAGCGTGCGT CCCAATCCAC 960
TTTTGCTATT CTAAGGACAG AAAAATACAC TTTGCGCCGT GGCGCATGGT CCAACAGTGT 1020
TCTGCTTATT CTCCTAATGA GTTATGGGTG TGTTTTGAGT ATAAACCAAT CAGAGACTCA 1080
TCTCCCATTC TCTTTCTCTC TTTCGTGGAT AAGGAAACAG TGTTGAACGC ACTCTGCTGA 1140
GGACATCCAT TACCCTACAT AATTAATTTA GTTTGTTAAG CGCAAAGATT TTTGTCAAAA 1200
CTATTTTGGA CAGGTGGACA AATCTAAGCG TGTTTTTATT AAAACAAATA TAAATATGCA 1260
TATAATAAAT ACTACTACTA ATAATAATAA CATTATACAA AAGCAAGTTG TCGTGAATAA 1320
ACTGAAAAAA GCCCCCTGAG ATGAAGAAGG CATGGAGGCA GTGTTCTTTT ATAATTACAT 1380
AGAAAGTAAT TCATTTTATT ATATTTTATT CCTTTAATTC ATTTTCATTT GTAAAGACGT 1440
TTCGTCATTT AGACTTATAA GGTTCTGTCT GACATTTCTG TCAAAATTGA GTTATTGGCA 1500
TTCTTTTTAA ATGACAACTC ATTTACATTA TGGAATGTCT TTTATA 1546