EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25839 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:7668274-7669940 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RORA(var.2)MA0072.1chr4:7668494-7668508ATGACCTACTTATT-6.34
RORCMA1151.1chr4:7668495-7668507TGACCTACTTAT-7.22
SIX2MA1119.1chr4:7669192-7669208GACTGAAACTTGATAT+6.45
Enhancer Sequence
ACACGGAAAA AGCCATGCAC CTTCACTGAA AAAAAAAAGA TTCATTGGAT TTCCTTTTGT 60
TTTTAGCTAA GTGGTTGCAA ACAATTTATA TGGGCTGAAA TTAAACAAAT TAAGTTGAAC 120
ATTACTAAAA AATAGTTTGT TTAAATGCAA CCCAAACCAA CTGTGTGCAA CCACTTACCT 180
TAAAACTCCA ATGGATCATC CTTTCAGTGT TCTTCATAGG ATGACCTACT TATTTTTTTT 240
TTCCACACAG TTTTTTCCAG GGTTAATAAA GTAAGGGGGA CATTTTCTAG CAATCTGATC 300
ACCAAGCGTT AGAAATCACA CACATACACA CACACACACA CATACACCGC AAAATGTGTG 360
CGAAGGAAGG AACACGGGCT CCTCCCGGCG GGTCCCGGGC AGGAAGAGGG TGACGTCAGT 420
GCGCTCCTCT CGCTGCAGAT TCGGGTTACA GTATAGCCTA TGCTGAGTGT GTGTGTATGT 480
GTGTGTGCGT CCGCATCCGC GTGTGTGCTC GTGTTCCTGA ATGTCGGATG GTGGCTAGAG 540
GAGGAAAAGC GTGTTTACAC AGACGGGCCG AGCGCCTGGG GAATCGCGCA CGGCGAGAGG 600
AAGTGAGCCG GCTCGCTGTC TGCCTGCTGC AACTTCCTGC TCACAGAGAG AGAGAGAGAA 660
AGAGTGAGTG AGTGAGAGAG AGAGAGAAAA CAGTCGGGAT CCCATTACAG TCCGACTGAG 720
AGCTGCCGAG ACGGCCGACA GCATGGAAAA ACAGCGCATT ATACGGAATT CTTATTAATA 780
AAGTGAAAAG GGAGCCCGAG CATTACGCAG AGGTACGTGA ATAACCCATT CGCGCTATCC 840
GATCGCTTTT TACGCGTTTT AAAAATGTAC TATTGATTCA CAATAACAAG TAAAAGGAAG 900
AGCGCTTTCA AAGTACAGGA CTGAAACTTG ATATCCAGAA AAAAAGAATG AAGCTTCCCT 960
TATGCGGGAG TGTTTACAAG TGATGTTTAA CACTTTGGGG TAACTGAATG GATCTGTTTT 1020
AGCGATAACA AACACCTCAA GTGTCCACCG TTCCCGTTAC TCACGCGCAA TTTACGCACG 1080
GTTTACGCAC GACTGGGGAA AGTTTGAATA CCTGTTGAGC TCACGATTTG GCGATGCGCG 1140
TTTCTAACAT TTTCCTGGTC GCACATTCGG TGCTAGAAAG GCTCGAATTT GGCTACTGCC 1200
ACTTTAAACG CACTAGTAGA GTTTCTGGTT TGTCTGGAAA CAGCAGCAGA CTAATTGCCA 1260
TGCGCTTCCG GATTGAAACT GGCAGCAGAC AGCATCTTGA AAATGAGTCA TTGGGGCAAA 1320
CAAAGAAACT TCAGTTCAGC CCTAGAGCTG ATGTTACCCC TGCATCTGGA TATACAGGAG 1380
TTAATGCTTA TGATTAGATG AGATTGATGT ATTTGATAGA CCTTCATTGC AATATAAGCT 1440
CAGAATTGAC CAAGGATGTG CTCAAGTTCA TTACGGGTTT CATATAGAGG CAGTCGTGTT 1500
GAACAATTAT GAAGTAAAAC CTGAGATGTT TTGCTCTGAA TGACACTAAT GCCACTTCAG 1560
AGGTCATTTC CTTCTCTTTT GGAGTTTTGG TCACTGTCAC ATTGTGTGTA AAGTCTACTG 1620
TCATGTTCCT CCTATCGACT TCCTGTACGG TTAGATTGGT TGGATA 1666