EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25799 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:6118795-6119889 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr4:6119546-6119556TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr4:6119546-6119556TTTAATTAGA-6.02
POU4F1MA0790.1chr4:6119688-6119702ATGCATAATTAATG+8.12
POU4F2MA0683.1chr4:6119688-6119704ATGCATAATTAATGAG+9.63
POU4F3MA0791.1chr4:6119688-6119704ATGCATAATTAATGAG+9.63
TBX19MA0804.1chr4:6119283-6119303ATTGACACCCATGTGTCATC-6.09
TBXTMA0009.2chr4:6119285-6119301TGACACCCATGTGTCA+6.13
TBXTMA0009.2chr4:6119285-6119301TGACACCCATGTGTCA-6.24
Enhancer Sequence
CTACTTCATC AGCACGTGCT ATGAAAAATA CAGTTAACAT ACAGTTATGA AAACATATTC 60
GTCTTGTATC TTGGGTGCAG TAAAAACGTC TAATAACAAG TTAGACCATA ACGTGTAACT 120
TATCATTACA TACATTAGTG ATATCAATCT GACAATAACG TTATGACTTG ATTAGCAAAT 180
ACTCATCTTA CAAAATTAAT AAGCACACTA TAAACGATTA CATGCAACGC ATCTGTTACT 240
TTGGTAAGCC ATGACGACAT TGCAAACATA AACGTAATAC TAAAACAATA AATCATCATT 300
TTAAAAACGA TAGTTCATCA TTCTTGACAG GAAATGAAAA GTACGCTAAC TTACAAGGTT 360
AACAAGGTTA CTTGGTTTAC TCGCTGTTAA GTTTAGTCAA ATAATGCACA TTAATCGTGT 420
AACGTTAGTA CACTTAATTA TCTGGGTGTT TATTTAACAG TCTTACCTTA AAGGTCTTGA 480
AACTGATGAT TGACACCCAT GTGTCATCGG ATCTTCCAGC ATAAAATCGC TTGAGTTCAG 540
TGGCAGTTTC CATAAATTAA TTCACATTTA ATCAATCGTA TGCAATCAAT CGTCGAATAA 600
ACAAGCTCCG TGCTTCTTTG TGTTGTCTTC AAACGATGAG TGATATCCAT CTGTCCAGCG 660
CGGAATTGAT TGAGTCAGGT GGTGGCGATT GGCCAATAAC AGGCATTTAT TTCTTTATTG 720
ATCTTATAAA GGTAGTGGGG GATTTTTATT ATTTAATTAG AACGTAATTT ATATTTATAC 780
ATATTTAAAA CTATTTTTTA ATCATTATTG TTTACACAGA TGTTTGACAG ATACAGTTAT 840
TATGAGGACG TTTGATGGTC AGCCAATCAC ATGCCGCGAT TTCATACACT CGCATGCATA 900
ATTAATGAGG GGATGCAGTA CCCAGTCCGG GCTACAGGGG CGCATGTCGA ATACACACGT 960
AATACACAAA ATCAGGTTTA TGTGAACTAT AAAGTCATGT GGAGAAATTT TGGATTTGAG 1020
CTCTTCTACA TTAAAGAAGC ACTTCTACAT TGCTAAAATT ATGAGGACTC CGACCATGTC 1080
CTCATAATTG AAAA 1094