EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25750 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:5009139-5010394 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NR2C2MA0504.1chr4:5009194-5009209ATAGGTCAAAGGTCA+6.74
NR2F1MA0017.2chr4:5009200-5009213CAAAGGTCATGTG+6
Nr2f6MA0677.1chr4:5009195-5009209TAGGTCAAAGGTCA+7.64
RXRBMA0855.1chr4:5009195-5009209TAGGTCAAAGGTCA+7.19
RXRGMA0856.1chr4:5009195-5009209TAGGTCAAAGGTCA+7.25
RxraMA0512.2chr4:5009195-5009209TAGGTCAAAGGTCA+7.25
SP1MA0079.4chr4:5010266-5010281CTAGCCACGCCCACG+6.51
SP4MA0685.1chr4:5010266-5010283CTAGCCACGCCCACGCC+6.68
Enhancer Sequence
AAAACATTAA TAATATGTGT AACGACATGA TTGACATTTA TTTGTTGTTT AGGTTATAGG 60
TCAAAGGTCA TGTGTGTGAG ATGGATAGAT GGATGGATGG ATGGATGGAT GGATAGATAG 120
ATAGATAGAT GGATAGATAG ATGGATAGAT AGATGGATAG ATGGATAGAT AGAATCATGG 180
ATGGATGGAT AACATCAAAT TGGATGAATG GATGGAAAAA AGAACATTTG ATGAAATGAA 240
AGGATGATAG AACATCAGAA AGAACGAGAG CGATGACAAG AATTAGATAG ATAGATAGAT 300
AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATATTA 360
GCCACTTAAA GAGCAAAAAC ACAAGAGATG CTTTATAATA ACATTCTATA TGTGTAAAGC 420
TAAACCCTCA CTGGTTTCTA TAGATCCCTA TCATGATGCA CTGGAATCTG CGGCCACTGA 480
CAGCGACGAG TTAACATGAG GATACAGCAC TACACACGTA TAGAGCCAGA TGCATACACG 540
CTCAGCACAT TTCACACGCG CATGTGCGCA CACACACATA CATACATACA TATACAGTGG 600
AAGGAGCGGG AATTACTGAC AGAAACAAAT GACAGAACCC TTCATAATAT TGACCCTTCA 660
AAGGCAATAC ACATGAAGCA AACGCATGTC CAAATCCGCT ATTGAACCAT TAGCCAGCGT 720
TCAACTGGAT GAGATTTCAA AGGAGAATGT ATTTTTAGCA CCAAGCATGC TACTAAAACT 780
CGAGGCATTT AAAAGCCCCC AGCAACAGTC ACCTTACACA CACACACACA CACCCCTGCA 840
AACTGTCAGC GTGCTCGGAT TACCTCCGAA TCCTTCTGCT GATGAAACCC ATCTCTCTCT 900
TGAGGCAGAC ACGTGTGTGT GTTACTGTTA GAATCATGAA TTAAAGGTAC CTCCATATCG 960
TCGGTCTGCT GCATCTGTCA GGCTGTGAAT CTGCTCTCCG TTTTGGAAAT ACGCTTGTCA 1020
CCCTGGAACA GACGCTGCTG GATCCCAAGT TCAGAATAAT ATCCGGCCCC GCAGATCTAA 1080
TTGGCTGCGA AACACAATAT AGGCGTGGAT TGATGTGACG TAAGCTTCTA GCCACGCCCA 1140
CGCCGCGCTT GACCACGAGA ATGCAGGTGC CACCATACTG CAATCTGGAG AGCACATAAT 1200
AATGATGATG ATGATGATGG TGAAAGCTTT TCTATGACTA GTTTTGCTTT CATCT 1255