EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25733 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:4696881-4698903 
TF binding sites/motifs
Number: 22             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr4:4698824-4698836TAAATAAACAAA+6.18
Foxj3MA0851.1chr4:4698774-4698791TACAGGTAAACAAATAA+6.22
KLF14MA0740.1chr4:4698626-4698640GGCCACGCCCCCTA+7.31
KLF16MA0741.1chr4:4698627-4698638GCCACGCCCCC+6.62
POU4F1MA0790.1chr4:4698803-4698817ATGCATAATTAAAG+6.34
POU4F3MA0791.1chr4:4698803-4698819ATGCATAATTAAAGCA+6.04
SOX21MA0866.1chr4:4697122-4697137AACAAATGCATTGTT+6.05
SOX21MA0866.1chr4:4697478-4697493AACAAATGCATTGTT+6.05
SOX21MA0866.1chr4:4697682-4697697AACAAATGCATTGTT+6.05
SP1MA0079.4chr4:4698624-4698639TTGGCCACGCCCCCT+7.53
SP3MA0746.2chr4:4698626-4698639GGCCACGCCCCCT+6.82
SP4MA0685.1chr4:4698624-4698641TTGGCCACGCCCCCTAA+7.45
SP8MA0747.1chr4:4698627-4698639GCCACGCCCCCT+6.92
Sox11MA0869.1chr4:4697122-4697137AACAAATGCATTGTT+6.8
Sox11MA0869.1chr4:4697478-4697493AACAAATGCATTGTT+6.8
Sox11MA0869.1chr4:4697682-4697697AACAAATGCATTGTT+6.8
Sox1MA0870.1chr4:4697122-4697137AACAAATGCATTGTT+6.05
Sox1MA0870.1chr4:4697478-4697493AACAAATGCATTGTT+6.05
Sox1MA0870.1chr4:4697682-4697697AACAAATGCATTGTT+6.05
TCFL5MA0632.2chr4:4698207-4698217TCACGCGCAC+6.02
ZNF384MA1125.1chr4:4698750-4698762AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:4698751-4698763AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
ACTATTTGTT CGGCTGTTTG TGTTGATTCA AACAGCATTT ATACATTGTT AAACACACAT 60
AATGCAACGT TTCCACATAA TGCAATTCAT AAACAGACAC ACTACCACCA ATATACTACT 120
TGCTGCAGGT CTTATGATAA CTTACATTAA CATACATCAT CTTTCCACAA GGATACAAAC 180
CAAGATGTGT GTTTATGATC ATATTCAGCT ATTCTTTGTG GGTGTTTGTG TCGATTCACA 240
CAACAAATGC ATTGTTAAAC ACACATAATG CAACGTTTCC ACATAATACA ATACATTACC 300
TGACACACTG ACTAACACAA ATCTATTACT TGCTGCGGTT CTCATTATAA TATCTGTTAT 360
TCCTTCACAT GGATACAAAC CTAGTATATT TCTAATAATA TTTAGTTATT TTTGTGAGTG 420
TTTGTGTTGA TTCAAACAAC ATATGCTATG CACACTACCA CCAATATACT AGCCTACTTG 480
CTGCAGGTCT CATGATAATT CATATTAATA TACTTGATCC TTTCACAAGG ATACAAACCA 540
AGATGTGTAT TTATGATCAT ATTCAGCTAT TATATGTGGG TGTGTGTTGA TTTACACAAC 600
AAATGCATTG TTAAACACAC ATAATGCAAC GTTTCCACAT AATGCAATTC ATTAAACGAC 660
ACACTACTAC CCCAAATATA CTTGCTGCAG CTAGGTCCCA TGATCATATC CGTTATCCTT 720
TCACAAGGAC TTCCCAAATA CAAACCTGGC ATATTTATTA TCATATTCAG CTATTTGTTG 780
ACGGTGTGTG TTGATTCACA CAACAAATGC ATTGTTAAAC ACACACACAA ACACAAGCAA 840
ATAAACAGAA ATGCCTTCTG TCACATTAAA CCGCTCCATA TGGCGGAGAA TATTTACCTA 900
TAGGAGATCT GCTTCCTGAA CGCCAGACCT TTGAGTTTAT CCTCCAGCGA GTCATCCATG 960
TCGGCGAAGC TGCTCAAGCT GTCGCTGCCG CCCATCGCCG CGTTTTTCCC GCAGCCGCGC 1020
GTCTGATCTT CCGCCGATTC CCCACCGGCG GCTCCTCTGC CGCTGCGCTC CGCCCGAGAC 1080
GCTCGCATGT CGGCTAGGGG GTCCATCATG CTCCGGTCGG CACCGAGTGG ACCCCCTTCT 1140
CCCCTCTGGT GCTTAGAAGT CCTTCCAAAT CCAGTGTCCT CCGATGTCCC TCATGTGTCG 1200
AACAATATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT 1260
CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTAAAC AGTCGACCGA TCGATTTATT CTCGATTTAC 1320
GCGCAGTCAC GCGCACGCAC GGTCGGCGCG GCTCTATCCA TGCAGAGCTA CAACAACAGC 1380
TGCATGCATC GGCGGGGACA GTATGGGATT TGCCTCCTCA TCCTCCAGCA TCAGGCGGTG 1440
AAAGTAGGGC AGAGGGTCTC CGGTTGGACA CACACGCGTG CGGATCTCTG ACGTGTCCGC 1500
GGTGACCGGG ACTGAAAGAT GCCCCAGTGG AGACGAGCCG CCGCCGGAGC ACTGCTGTTT 1560
ACGCGAGCCT TTAAACCGGA CACGATTGTC TTTTACAATG CCTTCGTTCA GACAGGACGC 1620
TCACGAGACA CTGAGAGCGT ACACATAAAT AAATAAATAT TTCTGAAATA ATAAACATAT 1680
TTTTGTTAGA TTATTTTGTG TTTGTAATTT GTTTTGTTGT CAGGAACCAG TAATATTATC 1740
AGGTTGGCCA CGCCCCCTAA CAAAAACCTA CTGTTGTAAT ATTATGATAA AGCCTATTTT 1800
AATATTGTAT TATATGATAT GGAATTGTAG TATATTAAAT TATGTGATGG AATACGAGGA 1860
CGAAACCTGA AAAAAAAAAA AACAATAAAT AAATACAGGT AAACAAATAA ATCCAAAAAT 1920
GTATGCATAA TTAAAGCAAT AAATAAATAA ACAAATAAAT CCACACATTT CTGCATAATT 1980
AAAACAATAC ATAAATAAAG AAATCCACAA ATACCTGCGT AT 2022