EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25729 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:4561390-4562487 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Ascl2MA0816.1chr4:4562324-4562334AGCAGCTGCT+6.02
Ascl2MA0816.1chr4:4562324-4562334AGCAGCTGCT-6.02
FOXE1MA1487.1chr4:4561392-4561407TCCAAAACAAACAAC+6.27
Foxq1MA0040.1chr4:4561409-4561420AATAAACAATA-6.62
Enhancer Sequence
CTTCCAAAAC AAACAACATA ATAAACAATA TAAATAAATA ACAATTCACC TTGAGGTTCG 60
GAGGTTTAAG CAAAGGCTTC TTGAACAGAG AAGTTCTGGC AGTGAAAAAA TATTCCTCTG 120
AATCCTCTTC CAAACTACTG TATCCACTAC TCATGGTGCT CGTCCACGAC ATTTGAAAAG 180
AAACTCTGAC ACATCCAAAA ACTGAGCTTT ATATCAGCGA AAAAATACAG TAAGATTTAA 240
CTTGAATCAG CACGAGTCAC TGTCGCTGCC TAACCATTCG CTTTAATTCG CTCAATAAGG 300
CGAAACAGTC GGCTAATTCC AAAAACGCGT TTACGTTTCT TGTTAAATGT GTATTACCTA 360
TATATATAAC AAAAGATCGG CGTGTTGAAA ATACTTTAAA TGCTCCAAAC GCCACGCAAA 420
TCGCGCTCAT TCCTTCTTAA ACACTTCTCA AACTAAAACT GAGTGACTAA CCGGAGCGGC 480
TCACTGGAAA AGAACACACC CACATACACA CACACACACA CTCTCAAATA CACACACAAT 540
GAGAAGCATT TCCTCGTTTA CTGCCTCCTG TTGCGTCCCC TACCTGCGCA CCTGGATAGT 600
GTTGTTTTCC GGATAACTCC TTTAATTAAC ATCTTCAAAG TGATATGATG AACTAAACGC 660
ATGTTAAACA AAAATATTAA TTTATTAGTA GTGGTAATCC GAACACACAG TTCCTCCGCC 720
ACTTAAAATA GTTCATTAGT GTAACTGTAC ACACTGTTGC CAAGCAACGT ACACTAAACC 780
GTGCAGCGCA TTAATACATA ATCCAAATTT AAAAAATGGC GTCGAGAATC GAAAGCGTCT 840
CACTTGCTCA ATTAATGACT TAATGTTGAT AACTAAGATA AAAAAACTCT TCTAACGAGT 900
AGTTTAGTTC ATTTAACTGT TGGCAAAGAA ATACAGCAGC TGCTTAATGC ATTAATACAG 960
CATTTTAAGA CATTTTACAA CTTCGAGTTA CACTCCATCA TTCATCTGCT TCAGTAGTAT 1020
ATTGTTTCTG TCCAAACATC AAATTATATA AATGTAAATC ATACAATGTA AGTTCACGTA 1080
CCTCTATAAG TATGCAG 1097