EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25674 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:2814326-2815245 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXK2MA1103.1chr4:2815021-2815032TTTGTTTACAT-6.32
FOXP2MA0593.1chr4:2815021-2815032TTTGTTTACAT-6.14
Hmx2MA0897.1chr4:2814390-2814407ACAATCAATTAAAAATT+6.86
Hmx3MA0898.1chr4:2814390-2814407ACAATCAATTAAAAATT+7.23
IRF1MA0050.2chr4:2814886-2814907TTCCACTTTCTGTTTTCATTC+6.21
IRF3MA1418.1chr4:2814492-2814513CCGTTTCCGTTTCGTTTATAG-6.64
IRF3MA1418.1chr4:2814486-2814507AAATTTCCGTTTCCGTTTCGT-7.28
MecomMA0029.1chr4:2815118-2815132AATATAAGATAACA+6.2
NFIL3MA0025.1chr4:2815037-2815048ATGTTACATAA-6.32
Enhancer Sequence
TAGATTATTA GCTTTTAGAT GTATTTATTT TCTCTAGGAC AGCAGAAAAC AGTGAAACAA 60
TGTCACAATC AATTAAAAAT TAAATAAATG TTTGTAAATC TAGACTTGTA GGTGCTTTAA 120
AGTGAGTTTC AAACATGTCC GCGTCAAAAA CAAACAAGTC AAATTTCCGT TTCCGTTTCG 180
TTTATAGACA TTTGACCACT TCCGCCTTTC ATAAAACAGT CTTTCAATCA ATAACATTTG 240
TTTTAATATT GACTAAACAT ATATAATTAG CAATTAATTT GTTGATAGCC CGCTCGTCAC 300
CGTCAATAAC AAATATTAAT GAATGAAGAT GAGCCGTTGT ACCAATGATT ACAGAGTTTT 360
ATCAGAGCTA ATGCGAATAT TTGTTATTAA TAATGTATTT TGATGAGGAC ACCGTCTCTT 420
ACTGCCGTTT AAACCGTGTA AAACTGTTAA ATATCTTACC TGTTGATCGA AAAAATATCC 480
CCGGGTTGGT TTAACCGGAA GTCGAGGTAT CTCCATCTCC AGCACTCGGA TGTTGATAGG 540
AAATTAAAGA GCTCGCCAAT TTCCACTTTC TGTTTTCATT CTGTTAACTA AATGACATGT 600
TTTCATTTTA AGAGATAGTT AAAAGATCAT TTATAATAAT TATTTGGCTA AAAACTGCAA 660
GTAGTACTTA CAATCAAACG CCGGACCGTC TTCTGTTTGT TTACATGCGT AATGTTACAT 720
AACCACGCCA AGCAGAACTC GATTTCCCCG CGAATTACAA CCCAACTCCG ACGGTTCAAT 780
TTACACATCA TCAATATAAG ATAACATCGA GGTATTATTT ATAGGCCATA TATCAGTATT 840
TAACTCAGTA AATGTTTGAT TTTATATAAA AAAGAGTTAT GCTGATAACA AAATGAAAAT 900
ATGGTATTAA AGTAGAAAA 919