EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25664 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:2423330-2424192 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr4:2423645-2423662ATAAAATAAACAAAATA+6.02
NR2C2MA0504.1chr4:2424040-2424055TGACCTTTGACCTAT-6.74
NR2F1MA0017.2chr4:2423347-2423360CACATGACCTTTG-6
NR2F1MA0017.2chr4:2424036-2424049CACATGACCTTTG-6
Nr2f6MA0677.1chr4:2423351-2423365TGACCTTTGACTTA-6.15
Nr2f6MA0677.1chr4:2424040-2424054TGACCTTTGACCTA-7.64
RXRBMA0855.1chr4:2424040-2424054TGACCTTTGACCTA-7.19
RXRGMA0856.1chr4:2424040-2424054TGACCTTTGACCTA-7.25
RxraMA0512.2chr4:2424040-2424054TGACCTTTGACCTA-7.25
Enhancer Sequence
TCTCTGTCTA TCACACACAC ATGACCTTTG ACTTATAACC TAAACAACAA ATAATTGTCA 60
ATCGTGTCGT TACACATTTT ATTCATATTT TATTTTCCAC CTATAAGAAA TAAATTGATG 120
CCATCTTTTT AGTTAATGTC AGCATTAAGG TTTCATTCAG TATTTGTCAG AATGTGGCTC 180
TGATGTGACA GTCTGTGAGT TAAAGGGTTT TCCTTTGCTA ACTTGTCAGA TGAGTTCCTC 240
TAGTGAACAA AAAAAGGAAC TTTGATGAAA TTAAAGATCA ATAATAAAAT CCAAGGATAG 300
ATGTACAAAA CAATAATAAA ATAAACAAAA TAATTGTTTA ATTAATAAAA TAAAACTATT 360
TAATTAATAA AAATACATAA AATAGTTGCA TATTGTTATT CAACATTAGT AAAAGCACTC 420
TGCAAGTTGG GTCTGAACGT TTCAAAGTTT GTCCACAACA GGGCAGCACG TCTTTTGTTA 480
TATTGTGTAA AATAAAAAAA GATAAAGTCT TATTTGTTTT ATTTTGGCAG TAATAAAATC 540
AGTTTTAAAT AAAATTAAAA AATAATTTTA AGGTCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT 600
ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTGTCTGT CTGTCTGTCT 660
GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT CTATCTATCA CACACACACA TGACCTTTGA 720
CCTATAACCT AAACAACAAA TAAATGTCAA TCATGTCGTT ACACATATTA TTAATGTTTT 780
ATTTCCCACC TATAAGAAAT AAATTGATGC CATCTACCTG TAGATACGTA GATGAAGAGG 840
CGCCCTCTAG TGTATCTAGG GT 862