EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25619 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr4:884485-885753 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GSX1MA0892.1chr4:885548-885558TTTAATTAGG-6.02
IRF1MA0050.2chr4:885094-885115AAAGAGAAAATAAAAGCGCAA-6.55
Nfe2l2MA0150.2chr4:885722-885737TGCTGAATCATCTTG-6.16
Nkx3-2MA0122.3chr4:885539-885552TTTAAGTGTTTTA-6.33
POU4F1MA0790.1chr4:885479-885493CTGAATTATTAATG+6.95
POU4F3MA0791.1chr4:885479-885495CTGAATTATTAATGCA+6.71
Enhancer Sequence
TGTCTTAGAG CTGAATAAGG TCTGATGTCA AATGATTTTT GTTCATGTGC GTATATTATG 60
TCTCTCCTCT TTATAACACG ATGTTATGCA CGAAAAATTT CAGATATAAA ACTGACAATA 120
AAGTTGGTAT TGCATTATAT TATCACTGAA ATCCTTTCAC CAACCCCTTT CTCACATGAA 180
AAACTACTAT AGCAACTTAC ACCAAACACT ACAGTACTTC TAAACCCTAG TAAAGTAATC 240
TGTTGTGGTA ATTCACTAGA GAAATATAAA CAAATGACTC ACTACTGTAG TTTTCAACAA 300
CTATAGGGTA TTAAACTACA ATGCAATGCA GTTTACTATA GTAAAAACTA AAGTACACTA 360
TTACAGTTCA TCAGCTTGCT ATGGTTAATA TGGACACAGT ATTTGCTATA AGAGTTACAG 420
TAAATACAAC CATAAATACA GTATAAAACA CTCTATTATG GCTCAAAAAC ACAATTTAGC 480
AACTATATAC AGTATTTACA ATATATGTGG CAGACAATCC CAAATGAGCA AAACACGAAG 540
ACTCACAGAC TCACAGAGCA AGAGATGAAG GCTATCAGAT GGCCCTGATG CTGCAGTTCG 600
CGCGCAAAGA AAGAGAAAAT AAAAGCGCAA ACGTCTGCAC TAATTATTTA CCTGCTTTAC 660
ATGCTCGTCA CACCCCTTAA AGCTCAAGCA CAGACCTGTT CACCTGAATT CACACTCCAA 720
AAAAAACTAA TTGTGATCAG TTAAGCGTGC AAACAGTAGG AAAATGTTTG CCTACCATGA 780
TCAGTTGCAC TCGCTGCTGT TCCGAGATCA GCTGATCCTG AAGAGCGTCA CAAACACAAT 840
GAGAAAACAC ACGTGCAAAT GCATCACTAT TATTATTAAC TTGATGAGAT GTGGGAGGTT 900
TACCTGTGGG TGTCCATATA TGTGCTGCTG AACAGGTGGA TCGAGAGAAC GCACAGGTAT 960
GACGGCTGTT GTGCAACGCT GCGGTCTGAC AACACTGAAT TATTAATGCA TTAGGGCTCT 1020
CCACCCACAG TTAGACTTTG GCGTCAACAC ACGGTTTAAG TGTTTTAATT AGGAGCTTCA 1080
ACAACAAACT CTCGCATAAA ATATCTTGCA GGCTTTCTGT TCAAACTGGT CTGCGAGCGT 1140
GTTTGGGCTT GATGGTTTTA TAGGCTGACA GAGAGGTTAA TGTTCACTGG AGCTGTAGGT 1200
TTGTGGGTCA CTATACACAC ACTCTCCCAT GGCTGTTTGC TGAATCATCT TGAGGAAAAT 1260
ATTAGAAA 1268