EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25576 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:62262431-62263993 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr3:62263579-62263596GGCTATTAATTAGTTCA-6.07
FOXA1MA0148.4chr3:62263931-62263947AATTAAGTAAACACAC+6.04
FOXD2MA0847.2chr3:62263932-62263945ATTAAGTAAACAC+6.02
IRF1MA0050.2chr3:62263289-62263310AATAGGTTTCGTTTTCTTTTT+6.19
IRF9MA0653.1chr3:62263293-62263308GGTTTCGTTTTCTTT-6.02
MEF2AMA0052.3chr3:62263499-62263511GCTAAAAATAGC+6.44
MEF2BMA0660.1chr3:62263499-62263511GCTAAAAATAGC+6.92
MEF2CMA0497.1chr3:62263497-62263512CAGCTAAAAATAGCT+6.56
MEF2DMA0773.1chr3:62263499-62263511GCTAAAAATAGC+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:62263202-62263214AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:62263201-62263213TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr3:62263200-62263212TTAAAAAAAAAA+6.44
Enhancer Sequence
CCAAATATGC CACTCACAAT ACTCTAATGG TGTGCTACAT TTTAAACAAC CTTGTAATTG 60
TTCAAATTTA TTTGCCCTAA ATTGTTAAAA ATTAGTGAAA CCTTCTTTAA AAATGCAAAC 120
TAACAGGTTT GGCAAAGCCT GTTTCTTTAC AGAAAGTTTG CTTATAACAA AGGCTTGTTG 180
ATGCCTTTGT GTGATATTGA GCAAACAAAG GGATGTTTCT GTGCTTGGTT GTACGAGTTA 240
TACCACTTCA TCATTAACGT TATCCATCAC ACATATTCAG TCGCGTCTGG TCAGATTTAT 300
TTGTCATTAC AGCAATACAA AACACTCTAT AACGTAACGG CAACACTGGA ATAAACCTTC 360
AAAACGGCAT AAAGAAAAGA CAAATAGCAT ATAAAACAAA TAAATGAGTT AATTAAATAT 420
CTCTCGCATT TTCATAAGTT TAACTTTAAG TTTCATAGGG ATTGTTAGCA TAAGCACACT 480
TTAGCATCAT GTGTAAATAT GTAACTTATC TGCCTCATAC AGTGACACGA ATCGTAATCG 540
CATCGAAATC CTAAATTACC TACGACACTC ACGGGTCCAT TTTGAGCTGA AACTGCTTTA 600
TAATGTTCTA AAAGCCTCGG CGGGTTAAAA CTGCTGCTGC CCCGGCGATC ATGGAGAAAA 660
AAACGACTGG TCTGGTCATG AGCCGCTCGC TGACGCCGGT GTTACACCGG ACCGAATCAC 720
AGCTGATCTC CTCACCTGCT TCCTGCAGGT GATCTCATAA AAGTAAATCT TAAAAAAAAA 780
AAACACGCAT ATTTTCGTCA CAACAAGCGC CACTAAAGTT CAGCGATAAC TAACGTTACT 840
GTATTTGTAA TGCGGATAAA TAGGTTTCGT TTTCTTTTTT AAAAATGTAG ACCTACAGCT 900
ACAGTTTGTG TTAACTTTAC ATCTATTTGA ACGGATCATT GCGCGCGCTC TTGCTCTCTC 960
AGTGCATCAT TTAATATGGC GCGGCCCGCT CTTTTAGAGC ATAACGCCCA CTTTACAAAT 1020
TACTACTAAC TTTACAAATT ATTAATAGTT ATTAAAAAGG ACTAAGCAGC TAAAAATAGC 1080
TTATCTAGTA AAGTAGACAG TATTGCAAAT AACGTGCAGT GGTCAAAACG TTTAGTCACA 1140
ACATCATGGG CTATTAATTA GTTCACAAAA CAGCAAACAA TTTCACAAAG TGCAGGAAAT 1200
AAACAGATTA CTGATACTAT ACAAATAAAA TCAAAGTAGT AATTAAAACG AAAAGTTTAC 1260
CTTGATTTTA CAGCAGTACA TCTTCTCAAT ATGAAATCCT GTCCTTCAAT GGCGGTGCTG 1320
GGTGGCGGTT GGTTGTGACT CGGGATGGGG GATGGGAAAT CACCACCCAG TACGCATGCG 1380
TACCAGCATG GCTTAGCTCT TATAAGCAAT TTTACTCCAA TTACATTAGT TATGGGAACT 1440
TTATACCTTA CTATGTCAGC AACACTAATG CATTTCTAGT AAACTCAACA ATTAGCTTAA 1500
AATTAAGTAA ACACACTAGA ATTTTGATAG TAAGGAATAC TATTCGCATT TACAGTGTGC 1560
AG 1562