EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25567 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:62083974-62085510 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr3:62085337-62085352GTTTAATAATTAACA+6.15
HNF1BMA0153.2chr3:62085338-62085351TTTAATAATTAAC-6.14
HOXA10MA0899.1chr3:62084138-62084149GGTAATAAAAA+6.62
YY1MA0095.2chr3:62084801-62084813CAAGATGGCTGA+6.04
Enhancer Sequence
CCTGCGCTCC TCTTTCTGTG CCTCAGTGCA TGCTGTCAGA TTTGAGTTTG AGCAGCTGAT 60
GCAGTGCGAT CTGGACACTA TAGTCACACA GGTGTGATCA TATGCTTCAG GGACCAGCCA 120
AGGTTGATCA CATCGGTGCA ATCGCATACG TGAAAGGGTT AACAGGTAAT AAAAAGGGCT 180
GTACGATACT GGAAAAAACT AGCATTGCTA TATTTTGTTT TGCTGCGATT TATGTATTGC 240
AGCATGAATA CATGTTCCAC AGATGATTTG AATAGCTCTA TTTAGAAATA ATTCATTAGT 300
TTAGATCAGG GGTCACCAAA CTTGTTCCTG GAGTGAAAAA GTGACCAAAA GTTTGGTTAT 360
AGCACCCGGC CATGTATATT GACCCTGTGG AGCTCCAGAC CAACAGTTCT GGTGGAAACA 420
GGAGTGTTGA GGTGGAGCGA GTCGGCAGCT GTGGTTTTGT TTTTTAGATA CAACCCGAGT 480
TGAGGCTGTT TCATACTTCT GCAGTCAGTG GGGGGCAGAG ATCAAGGGGA GACAGTTCTG 540
GGGAAAAAGC TGTTCCTCGG TCTGCTGGTT TGTGTCCGGG GGAGCCTGAA GCGCCTGCCA 600
ATATGCAGGA TAGTAAACAG TCTGTGAGCA GGGTGAGAGG AGTCCTAAAG AATACTGCAT 660
CTACAATGTT TCTTCTAGAT GTACTCAATG GCTATAAGCG TGGTCCCTGT GAAGCGTTGG 720
GCAGTTTTTA CCACCCGCTG CAGTGCCTTA AGCTCAGCAA CAGAGCAGCT TCTATACCAG 780
ACACAGTTGG TCAGGATGCA CTCTATTCTG CAGCGATAAA AGTTCACCAA GATGGCTGAT 840
TCTTCTTAAG TTGCCTTAAA AAAAGAGGAG CTGGTGAGCC TTATTGACCA GGCTGGAGGT 900
TTTAATGGTC CAGGACTGAT CCTTTGAGAT GTGGGTCCAC AGGAACTTGA AGGATGAGAC 960
GGGCTCAACG GCCATCCTAT TGATGTAGAT TGGATCATGT GAACCTGTTC GTCCTTTCCT 1020
GAAGTCCACA AAGAGCTATT TGGTCTTGTT GGTGTTAAGG AGCAGATTAT TGTCGGTGCA 1080
CCAAGTGGCC AGATGCTGTA TCCCCTCCCT GAAGGCCGTC TCATCATTAT TGCTGATTAG 1140
ACCAATCACT GTGGTGTCAT CTGCAAATTT GATGATGGTG TTGGATCTGT TACGGGCCTA 1200
AAAAGGGAGT AGAGGAAGGG GCTCAGCACA CAGCCCTGGG GTGCACCAGT GTTGAGTGTG 1260
ACGGTGGTGG AGCAGATGTG GTCTGATCTA ACATTCTGAG GTCTGTTAGT CAGAAAGTCG 1320
ATAATCCAGT TGCAGAGAGA CGTGTCGTAA TCCAGGTCTC TAAGTTTAAT AATTAACAAT 1380
AACAACTGTT CCCAGCACGG TTAGACAACC ATGCTGAACT GTGCACAATA AACTACACTA 1440
CGTTTAACAT GGGTAATCCA GATCTAAACA ATACAATTTG AAAAGGGTTT TAAAACCATA 1500
GAGCAGTCTC TGCCAGAGAA GGGAATCACT GGCCCA 1536