EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25530 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:61129119-61131082 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PAX9MA0781.1chr3:61130401-61130418TGCACCCATGGGTGACG-6.03
RFX1MA0509.2chr3:61130547-61130563AGTTGCCATGGAAACG+6.98
RFX1MA0509.2chr3:61130547-61130563AGTTGCCATGGAAACG-7
RFX2MA0600.2chr3:61130547-61130563AGTTGCCATGGAAACG-7.28
RFX2MA0600.2chr3:61130547-61130563AGTTGCCATGGAAACG+7.3
RFX3MA0798.1chr3:61130547-61130563AGTTGCCATGGAAACG-6.91
RFX3MA0798.1chr3:61130547-61130563AGTTGCCATGGAAACG+7.54
RFX4MA0799.1chr3:61130547-61130563AGTTGCCATGGAAACG-7.22
RFX4MA0799.1chr3:61130547-61130563AGTTGCCATGGAAACG+7.2
RFX5MA0510.2chr3:61130547-61130563AGTTGCCATGGAAACG+7.12
RFX5MA0510.2chr3:61130547-61130563AGTTGCCATGGAAACG-7.19
STAT3MA0144.2chr3:61129726-61129737TTTCCCAGAAG-6.62
Enhancer Sequence
CAGATCAAAT TAACATGTAA AATAGCTGAA GAAATATGTC ATCATCAAAT TAGTTTCCCA 60
CTAATATCAA AAGCAAATCT ACACTCTCGG TTGACACCAA TAAAATGAGC TAAATGAGGG 120
AATTTACACC TCAGCATAAT GAATGAGGTG AAAACAGAAA CTACTGATAT GAGCTAAAGA 180
GGATTTCAGC AGCTCCGATT ATATTGATGA GCTTCAGACT AGAGTCTCAT TAAACAAGCC 240
ATTCAGGATC AACAGCAGAT CAGCTCAACC TTATAAAATG AAAATCAAAG ACAAGTGAGA 300
TTCAGACCCT AATCTACACC CTACAAATAT CCATCCACAT AATTCTTATG TAATGTAAAT 360
TTAATCAATG CAAGTGTAAC CAGTCAACTT TTACTTAAGC AAAGAAGACA CCAAGTACAA 420
GTACTGCAAA ATACAAGTTA CATTAGTATA AAATGGCGAT TTGCTAACCT GCTTTTAGCA 480
CCAATACTAA ACTCTGAGAC CTGAAAATTC CTACAAAAAT TACATTAGCG GCGAAACAAA 540
ACAAAATCAC GCAACAAAGC TTTCATTAAC ATCACAAACA TTAAAACTTA CAACATAAAC 600
AATTAGCTTT CCCAGAAGAA AAAGAAATGT TTTCAGCAAC ATTTCTCCAC ACAACTTACC 660
CTCAGCGATG CACAGCAGCA ATGAGACGGA GCGAGGAGAG GAAGCGAAGA GGTACGGAAA 720
CCCGGGAGGT ACAAAAACGA CGATGTGTAT TATATTATCA CAGGACACAA ATAAAAATAA 780
CCGCTTAATA AAATTCACAA ATAATGAACA AAATAATTAA AAGTAGCAAA TTGTAAAAAT 840
AGTAGCTATT TAACAGAGTG CATTGACTCT GTTACACAAA GATAAAAATT GAGTATTTGT 900
GAAGAAAAAT GTTGTTTTTT GTGTTTAGGT TTTCAAAGAT GATCTCAGCC TACTTCAGTA 960
TAATATTAAC TTTGTCATGG TTTCAGTGTT TATAGGGGGA TCTGCACTGG TTTTACATAA 1020
ACTTTGATGA AATGTTCCCA ACATTCAAGT CTGTATTTAA TTTTTATGTT TTAAAAGCAA 1080
ATAGTTTATA ATGTTTTAAT GATATTTGTG AGCTTAACAA CATCTGTTTC AGTTACAGTT 1140
TTCTTTCAGG AGTTTGATAT TTCTCGTTCT CAAAATATTA ATGCTGTTAA CAATATATTT 1200
ACAAATTTAC TCTATATTTT TCCTGCTGCT TTATGCACTG ATCAGTACTT TTCAGACGTT 1260
TATGAAAGTA GGTAAATTTG TGTGCACCCA TGGGTGACGA AACAAACAAC TGAAATCAAG 1320
GTGTAACTTT AACAGCGGAT TTATTATTTA TGTAATGTTG TTCTGATGTT TATTTGTGTA 1380
AATGCTGCGT GATTTTGATG CGCGTGCGGA GTCCCATCCA AATGCGGGAG TTGCCATGGA 1440
AACGGGGCAA CAACACTCAC TCTGTCAGAC AGCAAAACTC CATCTCTCGC TGCTGTTTTC 1500
ACGGCTTTCT GGTAAGTTCA GAGCCTAAAA TCATTAAAAT ATGACATAAA ATGCTTTTTG 1560
ATCTTGATCT TTCTTAGTTA TTGTAATTAA CACGTTTCTG TTGCATATTT ACTTCATTTT 1620
AGTGCCTTTG GGAAAAGTCC GTTAGCATCT TCTCAACTGT TTAACCATTT GAAGGTAAGT 1680
AGCACTTGGC TTTCTACTCT ATAAAGCTCT TGTTTATAAG GTTTTACCTT TTTATTCACA 1740
TCTTTATATG TAGAAGAGAT GTTTTAATAG CTTTGTGAAG GCTGTGCTTG CAAGTAGTCA 1800
ATGTTTTATT GAAAGTAGTC AATTTATTTA GCCTAAAATA TGCGCAACCA CTGTTAATCA 1860
GTGATATCAA GGAGCTAACA TTCAGATAAG AGGAGGATGT CATTCTAAAC TACAAAATGT 1920
GTTGTAAATT TTTTGTATAT TCACAATAGA CATATGAAAA TCA 1963