EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25529 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:61122832-61123852 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BARX2MA1471.1chr3:61122887-61122899CTAATGGTTTTA-6.22
FOXE1MA1487.1chr3:61123289-61123304ATTGTTTATGTAATG-6.09
RFX1MA0509.2chr3:61123367-61123383TGTTGCCATGGAAACG+7.33
RFX1MA0509.2chr3:61123367-61123383TGTTGCCATGGAAACG-7.36
RFX2MA0600.2chr3:61123367-61123383TGTTGCCATGGAAACG-7.54
RFX2MA0600.2chr3:61123367-61123383TGTTGCCATGGAAACG+7.56
RFX3MA0798.1chr3:61123367-61123383TGTTGCCATGGAAACG-7.52
RFX3MA0798.1chr3:61123367-61123383TGTTGCCATGGAAACG+7.89
RFX4MA0799.1chr3:61123367-61123383TGTTGCCATGGAAACG+7.27
RFX4MA0799.1chr3:61123367-61123383TGTTGCCATGGAAACG-7.28
RFX5MA0510.2chr3:61123367-61123383TGTTGCCATGGAAACG+7.33
RFX5MA0510.2chr3:61123367-61123383TGTTGCCATGGAAACG-7.38
Enhancer Sequence
TTTGATGAAA TATCCCCAAC ATACAAGTCT GGCTTTATTT TTTATGTTTT AAAAGCTAAT 60
GGTTTTATAA TGTTTTAATG GTATTTGTGA CCCGTTTCAG TTAGTTTTTT TTTTCAGGAG 120
TTTGTTATTT CTCATTCTCA AAATATTAGA CTACACAGGA AAAAAAAAAG TTTTAATATT 180
TATATTGCAA TATTGCTGAT TAAATATCCA ATAATCACCC ACCACAAGAC ATTGTTCTTG 240
GACATAAGGG GGGCTCAATC AAGTCTGCAA ATCGTGTACT CCTTTTCTTA TTATCCTTTT 300
AAAATATTGG CCAATTTCGG ACTTCTGTCT TGTATGAAGA TTTGCAAACG TTATTTGAAA 360
ATGACATACT GTATGTCCAG TGATTCTTCT CAGCATAACC AGAAAACAAA GCTACAAACA 420
TGTTAATATG GTAGTGTGCC ATAAAATTTA ATTATTTATT GTTTATGTAA TGCTGTTCTG 480
ATGTTTATTT GTGTAAATGC TGCGTGGTTA ACAGATGCGC GCGCGGAGTC GCAGGTGTTG 540
CCATGGAAAC GGGGCAACAA CACTCACTCT GTCAGGCAGC AAAACTCCGT CTCTCGCTGC 600
TGTTTTCACG GCTTTCAGGT AAGTTCAGAG CCAAAAATAA TACAAAACAA ACACAAAACG 660
ATTCCTGACT TGATCATTCT AACTTATTTA TCGTAATTAA CACGTTTGTG TCGTATATTT 720
ACTTCATTTT AGTGCCTTCG GAGGAAGTCC GTTACTCTCA ACCGTTTCAG GCAAGGCACG 780
TAGCGCTAAC GTTAGGCTAA CTCTATAAAG CTCGTTTATA AAGGTTTTGT CTTTTTATTC 840
AAATCTTTAT ATGTAGAAGA GAGGTTTAAA TAGCTTTGTT AAAGCTGTGC TTGTAAGTAG 900
TCAATGTTTT ATTTGAAGTA GTCTAATTTA TTTAGCCTAA AATATGCGCA GCCACTGTTA 960
ATCAGTGATA TCAAGGAGCT AACATTCAGA TAAGAGGAGG ATGTCATTCT AGTCATTTTG 1020