EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25521 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:60898049-60899018 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4A(var.2)MA1494.1chr3:60898528-60898543AAGTCTAAAGGTCAT+6.46
Nr2f6MA0677.1chr3:60898726-60898740AAGTTTAAAGGTCA+6
RXRBMA0855.1chr3:60898726-60898740AAGTTTAAAGGTCA+6.14
RXRGMA0856.1chr3:60898726-60898740AAGTTTAAAGGTCA+6.33
RxraMA0512.2chr3:60898726-60898740AAGTTTAAAGGTCA+6.26
Enhancer Sequence
CATGTTAAGT CAATGAGAGT CTTTTGTAAT GGAAGTCTAC GGGACAGTTG CTAGGGTGCA 60
GTATGTGGTA GTTAGGGGTG TGGCTAGAAA GTTAAAAGCT CATCAGTTAT TGGCAGTTTG 120
GTAGTCTGAG TTAAATGAGC TCAGCCATTA GTCTATGACA GTCTGATGCA GAGTTATGAG 180
CTCACAAAGT TTGATCCCAT GTTAAGTCAA TGAGAGTCTT TTGAATGGAA GTCTACGGGA 240
CAGTTGCTAG GGTGCAGTAT GTGGTAGTTA GGGGTGTGGC TAGAAAGTTA AAAGCTCATC 300
AGTTATTGGC AGTTTGGTAG TCTGAGTTAA ATGAGCTCAG CCATTAGTCT ATGACAGTCT 360
GATGCAGAGT TATGAGCTCA CAAAGTTTGA TCCCATGTTA AGTCAATGAG AGTCTTTTGA 420
ATGGAAGTCT ACGGGACAGT TGCTAGGGTG CCATAAGTGG TTGATAGGGA GTGGCTAGTA 480
AGTCTAAAGG TCATCAGTGA TTGGCTGCTG GCTAGACTGA GTTGAATGAG GCCTGACTCT 540
AGTCTGTAGG ACAGTCTGAT GCAGAGTTAT GAGCTCACAA AGGTTGACTC AATGTTAAGT 600
CAATGGCAGT ATTTTACAAT GGAAGTCTAT GGGACAGTTG CTAGGGTGCC AAAAGTGGTT 660
GCTAGGGAGT GGCTAGTAAG TTTAAAGGTC ATCAGTTATT GGCTGCTGGC TAGACTGAGT 720
TAAATGAGCC CAGTTAGAAG TCTGTAGGAT AGTCTGATGC AGAGTTATGA GGTCACAAAG 780
TTTGACCCAA TGTTAAGTCA ATGGGAATTT TGGGAATTTT CCGGGTCGTT TTTCGGAAAA 840
CCGAAAGTCG GATCAGTCGG AAAAGATATA GCAACCCGAG TCAGACCAGT TTGAAGGTTT 900
GACGAAAGTT TGAGGTATGA AGCTTGAAAG GGTTAGGAGG AGATAGACTT TAAAATTAGT 960
CTCAGAAGA 969