EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25497 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:60196743-60197872 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr3:60197568-60197589GAACGCTTTCGGTTTCACTCT+6.03
IRF3MA1418.1chr3:60197571-60197592CGCTTTCGGTTTCACTCTGAG-6.04
IRF8MA0652.1chr3:60197572-60197586GCTTTCGGTTTCAC-6.03
Enhancer Sequence
TGGAGCTCAG CTCTCCTCAA ATGGCTCTGC AGCGAGCACC ACTTGGATCA ACTGCCAAAG 60
TAAGAGTGGT AAACAATACG GTTACCGTGT AATTACTGTT ATAAACTGAA CGATTGTGCG 120
AATTTAAAAC CAACTTTGCC TTAAAGCTTA TAATCGGGTC CCTTTTAGAG CCTTTAATCC 180
CCCTTTTACA TGGTTAGCAG ACTAAATTTA AATACAATAG AGCTAACGTT ACGAATTGAT 240
GAATTTGCTC TTCAGTGTTT GAACTCTCAG TAATGATTAA ATCACACTGG ACTGAGCTAA 300
ACTTAAATGA ACTTAAACAC TAAATACTGA ACTACACTGT TCCAGTTACT ATGACCATTT 360
CTGTGAAGCT GCTTTGACAC AATCTAACTT ACATTGTAAA AGCGCTATAC AAATAAAGCT 420
GAATTGAATT GAAAAACAAT TTCGGTAAGA ATAATGCTAT GAATAAAATC AGGGCCTGTT 480
TGGGCTCAAA GCAGCTGACC AAACGTCAAG TAACAAAAGA GTGACTGTGA ATACAAACAA 540
TTCTTCTACA ACTAATGATA ATTATTATAA TAATGATGAA GATGATTATA GATGATTGTA 600
CAACGTTAAA CCATGTCAGC CATTTTACAG TAGGCTAAGT TAACAGCTTT CGTCGAATAA 660
CACGACAGTA ACAGGAAAAG CTGAATCTAA GTTTGTGAGT TCGACATCAC ACGCAAATGC 720
TCTGTATGTT ATTCAAGTTA TGAAACTTTA CAACGAACTT ACCGTGTCAC GCGAAGGAAA 780
CTTTTGTTCT TCAATCCTTC GAAATGGCGT TTCTTCACTC ACAACGAACG CTTTCGGTTT 840
CACTCTGAGG TGGGGCTATG GGACGTCAGC TAGACACATA CGCTCAGCCA GTGGCGTTGC 900
TAGACATAAA GCTCTACTGG GGCACAGTTC TCCTTCCAAA TAAATAAATA AATATATATG 960
TTGAAGTCAA AATTATTACT CCCCCTGAAT AATTTGCCCC GATTTCTTTT ATTCCCTAAT 1020
TTCTGTTTAA CGGAGAGAAT ATTTTTTTCA ACACATTTCT AAACATAAAA GTTTCTAATA 1080
ACTGATTTAT TTTATCTTCG TCATGATGTC TGTAAATAAA ATTAAACTA 1129