EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25495 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:60125357-60126343 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA13MA0650.2chr3:60125871-60125882GTTTTATTGGT-6.32
HOXB13MA0901.2chr3:60125871-60125882GTTTTATTGGT-6.32
IRF1MA0050.2chr3:60125508-60125529ATTTTGTTTCCCTTTTTGTTT+6.06
ZNF263MA0528.1chr3:60126144-60126165CCTTCCACCCCTACATCCTCC-6.43
ZNF384MA1125.1chr3:60125971-60125983TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr3:60125972-60125984TTTTTTTTTTAA-6.44
ZNF384MA1125.1chr3:60125973-60125985TTTTTTTTTAAA-7.22
Enhancer Sequence
AGCCCTGTGT GAGGCTATTA TTGTGTTATT TATTGAGGTT GATTTTATAT CCACACATTC 60
CTTCAGTAAA AACTTGTGAC ACGCTCCCTA TATTGTTTAC CAAGGTACTT TTGAATATTG 120
GGCCTGACAT CACGCAAGTA TGATTTGAAT TATTTTGTTT CCCTTTTTGT TTAAATCCCC 180
TTAAGCCATT AAACTCAGCA AAGCTTAGAG ATACAAAAAG TAAACACAAT TTTAAAGCAA 240
CATTATCATC TAATAAAAAT AAAGTTAGAC CCAGCAAGAT TTCGTTGGCG AGCAGTGTTG 300
TAGCTCACGT GAATAAGAAA AAAAAGTTAT CAATACTCAC AAAATCCGAT GAAACGGTTT 360
GGTTTACAAA CACAGTACCA GTTCAGGATG AGAACGAGAT GAGATTAGCG AACTCCACAC 420
GTCTCTGACA CCCAACAGCG CTCTAATGGA GTTGAATCCT CCGTTCAAAA CACTGACGTC 480
CCACACGCTC GTCTTCTTTT TCTTCTTCTT GTGAGTTTTA TTGGTGGTTG GCTACAATTT 540
TCTTGCCCTT CATACATTCC TCTCAATGGA CGTGACATCA ACGTCTGACT TGTTACATGA 600
CGTCTGCGTC TACCTTTTTT TTTTTAAAGT GTGGTTTATT CATAAACTAA TTTCGAGAGG 660
ATCACGTGCT TATAATCAAC ACGGCTGGCT CCTTGTTAGC TCCGTAATCA GCCCTATTAG 720
ATGATTACGG AAGCATTATA AATACCCTGA GTTTTCCACT CCAGTTATCT TCGTCTTGAA 780
GCTCCCCCCT TCCACCCCTA CATCCTCCCA CTTTTTCTGA TCGGGCGACA CGGTGGCCCA 840
GTGGCTAGCA CTGTTGCCTC ACAGCAAGAA CACCGCTAGT CCAACCCATC GGGCTGGTTG 900
GTGTTTCTGT GTGGAGTTTG CATGTTCTCC CCGTGTTCGC ATGGGTTTTC CCCGGGTTCC 960
CCGGTTTCCT CCCACCGTCC AAAAAC 986