EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25450 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:58161247-58162096 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr3:58161782-58161792AACAGCTGTT+6.02
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr3:58161782-58161792AACAGCTGTT-6.02
IRF1MA0050.2chr3:58161663-58161684TACTGCTTTCGGTTTCAATAT+6.42
IRF3MA1418.1chr3:58161666-58161687TGCTTTCGGTTTCAATATCGA-6.97
IRF4MA1419.1chr3:58161666-58161681TGCTTTCGGTTTCAA-6.8
IRF8MA0652.1chr3:58161667-58161681GCTTTCGGTTTCAA-6.48
IRF9MA0653.1chr3:58161667-58161682GCTTTCGGTTTCAAT-6.41
MSCMA0665.1chr3:58161782-58161792AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr3:58161782-58161792AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr3:58161782-58161792AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr3:58161782-58161792AACAGCTGTT-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr3:58161283-58161296TTAAACACTTAAA+6.37
Tcf21MA0832.1chr3:58161780-58161794AAAACAGCTGTTAT-6.39
Tcf21MA0832.1chr3:58161780-58161794AAAACAGCTGTTAT+6.64
YY1MA0095.2chr3:58161314-58161326CAACATGGCGGC+6.37
Enhancer Sequence
GTGATAATCT TCTTGGCTCA CGTTAATAAC GCAGTTTTAA ACACTTAAAG CGCTGAAACT 60
TCGGGAACAA CATGGCGGCG GCTGGAATAT TTTTAAAAGT AAGTTATGTT CTCATTATAC 120
GAAATGACAA CTATGAATCA CATCAAACAT GATTAAATAC AGGCCTAGCT GTTAAATACG 180
TCCTTGTATG AAATGAAAAG CAATGTAGGC TAATTTAAAG TTGCGGTGTC CCGACTCGCC 240
CATGTTTTTT TTGGTCCTGT TTGTGTGTGT GCCCCTAAAA CTTCATTTGC GAACCGTCAA 300
GTGTTTGTTT ACACGCTTAA CTCAATCCCA TATATTCATG TGAAAGTGTT TCAACATACT 360
TACCACAACA AGCGAGGATT TGAAGACCTA TTTCGAATCA TTTGTAGTGT CGACTGTACT 420
GCTTTCGGTT TCAATATCGA CCAAACACTC ACTCTCAGGC AGCTGAGCTC AGGCTGAGCG 480
GAGGAGTGGG GAAAGTGGAC GCGGCTGGAA TGTTGAAGAA TGACGTTGTG TACAAAACAG 540
CTGTTATGTT GCCTGATGCA AACAGTACCT TGTATTATAT TAAATAGTTT TTTATTAAAT 600
GTACTGTCAT AAACACCCTG GTTTGTAGAG GAATTTGTTC ACTCATTTGT TACTATTCTG 660
GCAATCACAT ACTAACAAAT ACATGTATCT AATGCACAGT AAAACCTTTG TAATTCCAAT 720
GATAAAATTA CATAGACTGT ATAAAAAGAC TGTATACACA TCAGTGCTCC CAGTCCCAAA 780
AGGAATTGAA TGCAATGATG TCTACAAAAA TAAAATAAAG TGCAATGTAG TGAAAATTAA 840
ATTAAGTAA 849