EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25421 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:56879149-56880569 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr3:56879907-56879918CTAATTAATAT-6.02
DBPMA0639.1chr3:56879856-56879868TGTTACGTAACT-6.04
SOX21MA0866.1chr3:56879204-56879219GACAATAACATTGTT-7.09
Sox1MA0870.1chr3:56879204-56879219GACAATAACATTGTT+8.18
ZNF24MA1124.1chr3:56880235-56880248GATTCATTCATTC+6.74
ZNF24MA1124.1chr3:56880239-56880252CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr3:56880243-56880256CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr3:56880247-56880260CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr3:56880251-56880264CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr3:56880255-56880268CATTCATTCATTC+7.82
Enhancer Sequence
ACGTTGCTTT TTATAATTTC CTTTTTAAAG TAGTGGTTAA TTACATTATA GTTAAGACAA 60
TAACATTGTT GAAAACGACA GAGGAGATTC GCAACAGAGC GCTGATATTC ACACACACAC 120
ACACACATAC GCATGACACC TGTACAGCTG TCTTATTGTA TGGGCAAACA CAAACATGAT 180
TATTCTGAAT GAACAACACC GACTCACGCA TATAATAATA ATAAACAGCC TGTAAAGCCA 240
TGGTTGTGTA TGTGTGCGTG TGTATGTGTG TGTGTGAGGT GTTGCAGAGG TCTGGTAGGC 300
GCAGTCTCTC CATCTGGAAA CAAACACACG CTCCTGGTAA GAGCCTCGCA GAACAACAGT 360
CACACAAACC TGCGTCTTCG TGGTCAGCTG TATCACCGCC TTCCTGAAAT TGAGCTTTGA 420
GTCGGAATTC CCCATTTTCT GCTGTTATGA TGGTTTATTG ATGAGGCGCT GCTGTAATCC 480
CGTCTCCTCC TCCTCTGCGT GTGTCATTCG CGGAGGCGGC GGTGCTGCGC TAAAGCCGCA 540
AACTTCCGGG ATGACTTTAA CATTCCTACT ATGGGCAAGG AGAAGCTCAT GAATATTAAC 600
GAGGCGATGC CGTAAAACCA ATAGGCGTCG CTGATTGGCT AAACGCCACC CCGAGTTTTA 660
GACAGCCAGT AGTAAATGAG CCACTAATGG ATCTTTAATA TTACTTATGT TACGTAACTG 720
GACGCAGAAC AAGGGTTACC AAGCAACGCA TGTCGGCTCT AATTAATATT CATAAGTGCG 780
AATATCCCAT AGTAGGATTC GTACATTCCA AACACACTAG GCAGTGCAGT TGCCAGGGAA 840
AGACTGTTTA TCAAATACTT CATTGAATCA TTTAGCTTTC ACGGGCATAT CGACTCATTT 900
TGCAGTTATT TATTTATTTA ACTATACTTA ATATATAACT AATGTAAAAG CATTTCCATA 960
ATAAAATCCA AGCAACATAA ATTCGACTGG TGTAAAATGT AGCTTTCGGG TTACGCAGTT 1020
ATTTAGCATA TTCACCATTA CAAAAACAAC AACAGGAAAA CTGCTCTTAT ATATGATCAG 1080
GTAACTGATT CATTCATTCA TTCATTCATT CATTCATTCT TTTCGGCTTA GTCCCTTTAT 1140
TAATCTGGGG TCTCCACAGC GGAATGAACC GCCAACTTAT CGAGCATCTG TTTTACGCAG 1200
CGGATGCCCT TCCAGCTGCA ACCCATCTCT GGGAAACATT TATACACACT CATTCACACT 1260
CATACACTTC GGACAATTTA GCCTAACCAA TTCACCTCTA AAGCAGGTCT TTGGACAGTG 1320
GGGGAAACCG GAGCACCTGG AGGAAACCCA CGCGAACGCG GAGAGGACAT CCAAGCACAG 1380
AAATGCCAGC TGGCCGAGGC TCAAACCAGC GACCTTCTTG 1420