EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25382 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:55779515-55780384 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PBX2MA1113.1chr3:55780297-55780309GCTGTCAATCAT-6.44
PKNOX1MA0782.1chr3:55780292-55780304TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX1MA0782.1chr3:55780292-55780304TGACAGCTGTCA-6.92
PKNOX2MA0783.1chr3:55780292-55780304TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX2MA0783.1chr3:55780292-55780304TGACAGCTGTCA-6.92
POU4F1MA0790.1chr3:55779750-55779764AATTAATAATTCAC-6.41
POU4F2MA0683.1chr3:55779748-55779764CTAATTAATAATTCAC-7.1
POU4F3MA0791.1chr3:55779748-55779764CTAATTAATAATTCAC-7.27
TGIF1MA0796.1chr3:55780292-55780304TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF1MA0796.1chr3:55780292-55780304TGACAGCTGTCA-7.22
TGIF2MA0797.1chr3:55780292-55780304TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF2MA0797.1chr3:55780292-55780304TGACAGCTGTCA-7.22
ZNF384MA1125.1chr3:55779528-55779540AATAAAAAAAAA+6.62
Enhancer Sequence
ATTGAAAACT ACAAATAAAA AAAAAGTAAT TAATGCAATT GATTAAAACT TCATAATTTA 60
ATTTACCAGA AACAAAAGTA TAACATTATT TATTATTCAC AATACATACA CAATTCATAT 120
TTTTTTGTGT GCCACCCCTA AGAAAATTTT CTGGGGGCGC CACTGCCAAA AGGGTCAATT 180
CGAACAATAC ACAAAGGCAA AATTGAGAAT TTAAGAGCTC TAAACGAAGT ACGCTAATTA 240
ATAATTCACG GGATGGTTTC TGCTTTGGAA ATGTTCATTG AAGGTATATT CAGGTAAATT 300
GAGAACTGTA GTGTTGTTTT AGTCCAGGAG GTGACGCTGT ACTCGCGTGT TTTGGCGTCG 360
AGCAGACAGG CGTGATAGAG AGTGTTGACG TCAGTGTAAA GCGAGAGAAG CGCGCGGCAG 420
GAACAGGAGA GACGCAGCTG AGCGCGTGCA GTAAACGCGT CGCGCAGCGG AGGAGAAACG 480
CACACACTCA CACACACACT CACTCACACA CACACACCTG AGGAATAGCG GCGCGATGGC 540
TGATCATCTG ATACAGATCA ATGACTCGTC CGCCGGAGTC AATCGATTCG CGCGGAAAGG 600
AGCTCTGCGA CAGAAGAACG TGCACGAAGT TAAAAACCAC AAATTTATCG CTCGCTTCTT 660
CAAGCAGCCC ACCTTCTGCA GCCACTGCAC CGACTTTATC TGGTAAAAGA CTCTGCGCTC 720
GACACTCATG CATTACATGC CGAAGTTTGA GAAATATGCA CTTTTTAATG TTTGCTCTGA 780
CAGCTGTCAA TCATCTCTTT ATTGGATTGT GGCATGCGTA TTGTCAGTAA TTCATCTTTT 840
ACTCTCATAG AAAATTGAGG TGCATGTAT 869