EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25360 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:54957635-54959726 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr3:54958363-54958380AAAGAATAAACAAACTC+6.21
POU2F2MA0507.1chr3:54958536-54958549ACATGCAAATGCA-6.37
TWIST1MA1123.1chr3:54958644-54958657GAACATCTGGAAG-6.07
ZBTB18MA0698.1chr3:54958644-54958657GAACATCTGGAAG-6.48
ZNF384MA1125.1chr3:54959297-54959309GATAAAAAAAAA+6.02
ZNF384MA1125.1chr3:54959300-54959312AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:54959301-54959313AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:54959298-54959310ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr3:54959299-54959311TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
GGAAACTCAG AGCATATTTG TGTAACTTCA ACTCTTGGGG AGACATGTGT GACTTTTTAA 60
CCACATGACA TAAAATTGAG AAGTATCAAT GCCATCAAAG AGAAACATTA AAGAGGTCCC 120
ATTTGGGATT GTTCTTCCCA ATGAAAGGCG CGGTCCTCAG AGGATCTCAG TCATTAAGTG 180
ACACGCTGAG AAACATCAAC AATTAAAGGA AATTAAAAGA GCTCAGACAG ATTGACAGTG 240
GCTTAATTTC ATTAGTCTTG CAAACATCAT TTAGACGCCC AGCGTGTGGT CCACCGTACA 300
AATGGGGTTT ATAACCGCGC ATTCCTGATG AGGAATTCCA CATCTTCAGC CCGCGCGCCA 360
AATGACGCGC GCCGCCGCAT TCCAGCACCG CGGCGCGCGC GTCGCAGGGT CTGTGCTCTC 420
GTCACTTCAG TCAGTTTAAA CTCACAGGCG AGAATGACTC AAAGTAACCC TCAAAACAAA 480
AACAACAAGT GACGACAACA AAATAATAAT AAAAAACACA AATACAAGAC ATAAGAACTC 540
ACTTAAAGTG ATAGTTCACC CCCAAAATAA ATTATGCTCA TAGTTTCTCT CTCTCAAGTA 600
GTTCCAAACA TTCCTGAGTG TCTTTTTTTT CAGTTGAACT CAAAAGACGA CAATTTGAAG 660
AAGGCTGGAT AAATATGAAG TCTAATGGTT ACATGTTTTC ATCATTAATC GAAATATCTT 720
CGTGTTCAAA AGAATAAACA AACTCAAACA AGATGCCTGA CAGGTGAATG ATGATAACGA 780
CGACTGAACT TTCAGTTTTG GATGAACTAT CCCCCTACAA GTTTTCTTAA GTTTATTATT 840
CATTCACCTC TTCTCTCCTC TCACGATCTC AATCACAAGA AAAGGTGTTT GACAATCAAT 900
AACATGCAAA TGCAAAGCAA ACACTGAAGC GCACGTGTGA AACCCAACAA GTTTTTGGCC 960
AACCCAAAAT CAAGGCCAGT GAATTGAACG CCACAGCAGT GGAGTGGAGG AACATCTGGA 1020
AGTAATGAAG AGCTCCAGCA GCAGTCCCAC CCTCTCCCCA GAGCCACAGC AGTCACGGGG 1080
CTTTTCTTTT CACCTCAAAC CGCCATCAGC ACAAAATCAA CCGACATCAC CGACGACGAG 1140
CATGCTTAAA TGCGAGCACA AGAGCAATAT TCAGATGTAA CAACACACAT ACACACATTC 1200
TGCTTTAACC ATTACAAAAC GCGCGCGCAC AAACGAATAA ACACTTCAAT TAAAAAAAAG 1260
AAAGAAAGAA TCTATTGATT CAGTTCATGA TATAGCTTTA TGCCCTATAA ATTAAATATA 1320
ATTCTACAGG CGCGCGCATG TGAACTATAA TAACAGTAGC CTACTACTAA ACGCATTGTG 1380
CGCGCTTCCC CATGAAATAT GGCATTTTCA CAACCCATCC ATTAAAATAA ATTTTAAAAA 1440
GGTGCAATGC TTCTTAAAAA GATGAAATAT CACCTATCTG AATAATACCA ATAATAAAAG 1500
GCCTGCAATA AGTCCGTTTT AAAGCATAAA TTCCCGTCGT AGCACCGTTA CTTTAAAACT 1560
CTCCAAGAAA AACCCGAGCA GCACAAAGGC TGAGCATCAC AATACGCATG GACGCAAATG 1620
GACGTCCACG CGCACACACA AATAAGTGTT AATGGTTTGT TTGATAAAAA AAAAAAAACA 1680
ACATGTGTGA ATTGTCACCT ACCCTCTTCC AGTGTCCTCA GTCGATAAGG CCAGCAGACT 1740
CACTGACAGA GACAAAAACA CCGCAGCCCA AGCGTGAAGC GCGTCCCCTT CTCTCTCTCT 1800
CTCTCTTAAA GAGACACTCC ACCTTTAACA CCACAATCTT CATCAAAAAT TTGCTCGTTA 1860
TTTTCACTTA AAATTAAACA TCCTGGATCA GTATTACAGA AGATGGTGTT ACATCTGGAC 1920
AGATTTTAAA ATTCACCGCT CGGTATGAAA TTCAATAGTT GTATTGAATA TCATGGCAAT 1980
TTGTAATTTG ATAACGACAC AGCGGTGGGC CTGACGTCAT AATGGTCTTA CGTCATTATT 2040
ATAGGCTAGT CCATACCCAG GGCTGCAAAG AGACATGAAG CTGACATTAA T 2091