EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25352 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:54489267-54490640 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr3:54490568-54490579ATAATTAATAT-6.02
FOXC2MA0846.1chr3:54489850-54489862ATTGTTTACATT-6.32
IRF1MA0050.2chr3:54489482-54489503AATGTAAAACTGGAAGTGAAA-6.07
RFX1MA0509.2chr3:54490155-54490171TGTTGCCATGGTTACA-6.94
RFX1MA0509.2chr3:54490155-54490171TGTTGCCATGGTTACA+6.95
RFX2MA0600.2chr3:54490155-54490171TGTTGCCATGGTTACA+6.77
RFX2MA0600.2chr3:54490155-54490171TGTTGCCATGGTTACA-6.83
RFX3MA0798.1chr3:54490155-54490171TGTTGCCATGGTTACA+6.81
RFX3MA0798.1chr3:54490155-54490171TGTTGCCATGGTTACA-6.92
RFX4MA0799.1chr3:54490155-54490171TGTTGCCATGGTTACA+6.97
RFX4MA0799.1chr3:54490155-54490171TGTTGCCATGGTTACA-7
RFX5MA0510.2chr3:54490155-54490171TGTTGCCATGGTTACA-6.14
RFX5MA0510.2chr3:54490155-54490171TGTTGCCATGGTTACA+6.27
Enhancer Sequence
ACATGCTGGA TAAGTTGGCG ATTCAATGAC CAAATGTAAA CCATATCGTT TGAGTTTGCC 60
CATATTTTAC CAAATTTGGA ATTAAATAAA CCAGCATTTT TAGTGTAAGT TATTCGTTGT 120
GTAGTAGTGT AGTAATTAGT GAACTATCCT CTTCATGACA AATCATAAGC TTTGCTGAAT 180
TTCTGGTGAT TTCCAGTGTG ACGGTGGGTC ATGTGAATGT AAAACTGGAA GTGAAATACC 240
GTGAAATAAG AAGGAGCTAC GGAGTTTTAG TTTAGTCAGT TGCTGCTCCC CTAAGAGTAC 300
GGGACATTCC AGTAATCTTC ATTACAGCTC GTCTACACAA GGGAAGGGGC AGTTCCGCTG 360
ATTAAACCGC TGCTCACTCT CACTTTTATT CTCTCAGTGG TCGAAGTGTA ACCAGATCTA 420
CAACAGTGAC AGGACAATAC TAAAGCCCAG GACTCGAGCT GAACCTAGTT TGAAAATGCA 480
GAAAGGGTCG TTCTTTCTCG GCAAATCTTC ACGGATGTCC CATATAGGAC TACTCGGAAT 540
TTGTTTTCTC TCACTAGTTG CAGGTAACGT TAAGCGCTTT CTAATTGTTT ACATTTGCTA 600
GAGAATAACT GCGCCACTTT GTTTTGCATG TTACCGGTTT AACCCGAACA ACTGTGGATG 660
AATTTGGAAT ACAGAAATAA CGCTAGTAAT CCATAATGGC ACTTCATTTG ATAGCTTTCA 720
CGTCTAACAA AGAGAAAGAG TCTATGTAAG TACCGGACCG AAAGAGAAAC TTGGCTGAAA 780
GTCCCGTTAG CCGGTGATGG AGAGAATAGG CGATACATTT ACTATCGTGG CTCAGATTTT 840
ATATATAGAT TAAGTTTATT TACCTGTCTA ATTGTGTATT TTAAGCCATG TTGCCATGGT 900
TACACCATCA GGCGAACATG TACACGTCAA GTGAAAATAC GATTATTGAA GTTTAAAGCT 960
GGTGGTTTTA GACGCAAAGT TGTGTAGGCT AGGCTGATTT TAACTTTACA GAAGCTGAAA 1020
ACAAGGTATG TAACGTCGTG TTTTCTCTCC CTCTCTTGTG TTTGGCACCG AACGACTCTG 1080
CTCAGTAAAT GTTGAAGTCT AAATATTGTC TTCAAATTCC AGAAGGGGGC GCGATACCAT 1140
TTCATTATAA AAAGTTTCCT TTAGATCCCT TTCGCTTTTT TTATTGCAAT TTAGAACACA 1200
GATACAAGGG CAATAACATA ACATTAAATT GATATCAAAA TAAATACGAT AAGAAATATA 1260
AAAAAATACA ATTATTCAAA TAGTAGATTT AAGGCTTTAA GATAATTAAT ATTTTATTGT 1320
ACACAGGTAA ATTACCTTCT ATTTTAAAGT GAGTGAAAGT GTTTTCACTG CCC 1373