EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25329 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:52699257-52700261 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxa2MA0047.2chr3:52700006-52700018TGTTTACTTTGT+6.18
HLTFMA0109.1chr3:52699666-52699676ATATAAGGTT-6.02
SP2MA0516.2chr3:52699731-52699748AGGTGGGCGGGTCTTAT-7.31
SP4MA0685.1chr3:52699730-52699747AAGGTGGGCGGGTCTTA-6.14
Enhancer Sequence
TTGTTCCAAG GCCTTTCACC AAATTTAAAG GCCTGCTGTC CATAACATTG GCCTTTTGTC 60
ATCCAATGAA GCAGCTGTAA AGCTCTGCCT GTGGTAGTCT GAGGAATATC CACTGGGATG 120
AAGAGGAGCA TAACAGCACT TTGTTTCAAG CACAGAAGTA AGCAACATTT TCTGTTTTTA 180
TTCACAGTTG TTGATATGTT CATAGATCAT CAGTTTATAC ACCACACAAG CCTGCAGAGC 240
AAAAGCATTG CTTGTTTTTA TTTTCGCCTC TTCTTCATAC CGCACACAAA AGTTTTGATT 300
TTGACCAATC CAGTGAGCTT TACACTGAGT ATATGAAAAT ATAATTTATT CGTGTCCACA 360
TGAACGTACA CCTTGTATAA ATGAATGATT TTTCCTTATG CCATGTTTGA TATAAGGTTA 420
TCGACTGTAA TCTAACACGA CTACAGATCC CAAAAGCCAT CGCGGTGGAA ATGAAGGTGG 480
GCGGGTCTTA TCAGTCGACG CGCGGGCTTT GAAAGAAAAT GGCGGAGCCT CTGAATCAAG 540
AAGGCTACGA GACGTGAGTG TTTTATTATG ATTACATTTT ATGTTTACCG GTGACATTTG 600
ATTGTATCCT TGCGCAAACG TTGTCCTTTA ATAGAAAAGA AGTCTCCCCA GTTTTAAAAT 660
AATGTTGATG TTGTCAAACT GCTAACGTTA AACTTGACTA TACTAGGAAC TAAAACATGT 720
TCTTAGATGT TTTGTCTATC AAAGCAAGCT GTTTACTTTG TTGCATGTGC TGCATTTTAA 780
ATGACCGTCT ACTCTCTCTC ACAGATGTGA TGCCAGCAAC ATCAATACTA TGGTAAATCT 840
TTTTATGCTT TGTTATTTAT GTACGTTAAC TGTTGCCATT TAACGTTAAA GCTTTGGAGT 900
CAGTGTCAAA AATCGTTTTG AAATAATTAA CGTTACATCT ATTCAGCAAA TGAGCATATT 960
ATAATAACAC ATGTTCTATT CTATATTTAT GTACGTTATA TTCA 1004