EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25273 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:49561342-49561920 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxa2MA0047.2chr3:49561650-49561662CCTGAGTAAACA-6.37
RXRBMA0855.1chr3:49561751-49561765GGGGTCAAGGGTTA+6.1
RXRBMA0855.1chr3:49561831-49561845GGGGTCAAGGGTTA+6.1
RXRGMA0856.1chr3:49561751-49561765GGGGTCAAGGGTTA+6.32
RXRGMA0856.1chr3:49561831-49561845GGGGTCAAGGGTTA+6.32
RxraMA0512.2chr3:49561751-49561765GGGGTCAAGGGTTA+6.12
RxraMA0512.2chr3:49561831-49561845GGGGTCAAGGGTTA+6.12
Enhancer Sequence
ACATCTAGAT GATATTTTAT ATTCAATCAT TTGTTGTGAA ATTTAAATGA CTTGGATAGT 60
TTTCTATTCT GCCACCATTT ACTTCATGTT TTAAACCAGT TTGAATTTCT GTCGAACACT 120
AAAGCAAATA TTTAAAAAAA ATGTTAGAAA CCAGTGAAGT GGATTTTATA CTCTTTAAAG 180
TGTGAAGTTA GTTTATATAT TCAAATTGTA TGTGTATAAT CTGCTTGTAG ACTTGCATAC 240
CATTAAAAGA ATTAAGGTGC TATGTAGAAA GGGTCACAAG AAGTGGATGA GAAGAGAGCT 300
GGAGAAAGCC TGAGTAAACA ACTAAGGTGT CTCAGGAAAT GGATAAGAAT AGAGCAACAC 360
ATGTGTAAAC AGATACGTAT AGATGGATAA GATATATGGT TATCAGGTTG GGGTCAAGGG 420
TTAAACTAGG GGGGGTCTTG TATGATATAT GTAGAACTAA GACAAAAACA AATGACAGAG 480
GTGGAATTTG GGGTCAAGGG TTAAACTAGG AGAGATCTTG TGTAACATAT GGAGAACAAA 540
GGAAAAAAAA CTGTTGTAAA AGAATATTTA AGCAGGCC 578