EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25261 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:48863362-48864256 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr3:48863424-48863435GTTTTATGACC-6.02
CDX4MA1473.1chr3:48863424-48863435GTTTTATGACC-6.02
POU6F1MA0628.1chr3:48864142-48864152ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:48864142-48864152ATTAATTAAT-6.02
TCF3MA0522.2chr3:48864188-48864198AACACCTGCT+6.02
ZNF24MA1124.1chr3:48863793-48863806CATTCATTCATCA+6.11
ZNF24MA1124.1chr3:48863777-48863790CATTTATTCATTC+6.48
ZNF24MA1124.1chr3:48863773-48863786CATTCATTTATTC+6.5
ZNF24MA1124.1chr3:48863769-48863782CATTCATTCATTT+7.34
ZNF24MA1124.1chr3:48863781-48863794TATTCATTCATTC+7.52
ZNF24MA1124.1chr3:48863785-48863798CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr3:48863789-48863802CATTCATTCATTC+7.82
Enhancer Sequence
CTATAATTAA CTGATTATTG TTAAATCAAT AGTCTTTAAA TCATTGTAAT TTGCATTGTT 60
TTGTTTTATG ACCTGTAATA ATTAATGATA TTTTGAATAA AGGGAAAAAA CAAGGCCTTG 120
TGATCTTATA GCGTGCGCGC CCGGGCTAGT CAGCATACAA ATATTGTTGA ACATTGGTTT 180
TAAATAACGC CGCCTTTTTC TTTGACTGAC ATGCCTTTAA ATTGCGATTG ATGAGCTCGT 240
GCGTTTAGGC GGTTGTGTTG TGTTGTGTAT AGTTGTGATG TGCTTGTCCT TGAATTGTGT 300
ATACGCGCCT GGAGAAGGTT ATCTGACTCA ACGGTTTTAT GTGCTTGGCA CTGCGGTAGA 360
GACTCGTGCT CACGGAGGAC TGCGGAACAA CATGCCGAAG GGCCCGTCAT TCATTCATTT 420
ATTCATTCAT TCATTCATTC ATCACACCGT CTATTAAGGA TTAAAATGAA AGGCAAGCGC 480
CTCGTTTTGT CTCGGCTTTT GTCTGAGGTC ACTATAAAAT AACACCGGCT GTCCTTAGAC 540
GAATATATAG CCTATATATT CCACTTATTA TTTTCAAGAC CATAGGCCTT TAAATAAAAT 600
AAAATGTAAA TGAATAATGT GTATTTTTAC TTCTTAAAAA GCTTTAAAAT AATGAAATCA 660
AACATTATTT TATTGAAGAT ATAATTCCCT GAATCTCTGA AAACGTATCT CTGAAAAGAA 720
ACAAAGGCGA TTACTCTTAC TACACGCTTC ATTTATATCA GGCCTGGACA TTTAAACGTC 780
ATTAATTAAT CTTAATATTT TAGACAATCT TTTTTGGGTG GTTTCAAACA CCTGCTCGTG 840
TTAAAATGAG CAGTTTTGTT ATTGTTTTCA CGCGGATTAT CTACGTGAAG ATGG 894