EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25240 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:48262364-48263957 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr3:48263544-48263561GGCTATTAATTAGTTCA-6.07
FOXA1MA0148.4chr3:48263895-48263911AATTAAGTAAACACAC+6.04
FOXD2MA0847.2chr3:48263896-48263909ATTAAGTAAACAC+6.02
IRF1MA0050.2chr3:48263258-48263279AATAGGTTTCGTTTTCTTTTT+6.19
IRF9MA0653.1chr3:48263262-48263277GGTTTCGTTTTCTTT-6.02
MEF2AMA0052.3chr3:48263464-48263476GCTAAAAATAGC+6.44
MEF2BMA0660.1chr3:48263464-48263476GCTAAAAATAGC+6.92
MEF2CMA0497.1chr3:48263462-48263477CAGCTAAAAATAGCT+6.56
MEF2DMA0773.1chr3:48263464-48263476GCTAAAAATAGC+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:48263171-48263183TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
CTCACAAACT GGTAGTCTGA AATAAAAAAT AAATAAAGGG TATAATGATA TTACAAACCA 60
AATATGCCAC TCACAATACT CTAATGGTGT GCTACAATTT AAACAACCTT GTAATTGTTC 120
AAATTTATTT GCCCTAAATT GTTAAAAATT AGTGAAACCT TTAAAAATGC AAACTAACAG 180
GTTTGGCAAA GCCTGTTTCT TTACAGAAAG TTTGCTTATA ACAAAGGCTT GTTGATGCCT 240
TTGTGTGATA TTGAGCAAAC AAAGGGATGT TTCTGTGCTT GGTTGTACGA GTTATACCAC 300
TTCATCATTA ACGTTATCCA TCACACATAT TCAGTCGCGT CTGGTCAGAT TTATTTGTCA 360
TTACAGCAAT ACAAAAAACT CAATAACGTA ACGGCAACAC TGGAATAAAC CTTCAAAACG 420
GCATAAAGAA AAGACAAATA GCATATAAAA CAAATAAATG AGTTAATGAA ATATCTCTCG 480
CATTTTCATA AGTTTAACTT TAAGTTTCAT AGGGATTGTT AGCATAAGCA CACTTTAGCA 540
TCATGTGTAA ATATGTATCT GCCTCATACA GTGACACGAA TCGTAATCGC ATCGAAATCC 600
TAAATTACCT ACGACACTCA CGGGTCCATT TTGAGCTGAA ACTGCTTTAT AATGTTCTAA 660
AAGCCTCGGC GGGTTAAAAC TGCTGCTGCC CCGGCGATCA TGGAGAAAAA AACGACTGGT 720
CTGGTCATGA GCCGCTCGCT GACGCCGGAC CGAATCACAG CTGATCTCCT CACCTGCTTC 780
CTGCAGGTGA TCTCAAAAAA GTAAATCTTT AAAAAAAAAC ACGCATATTT TCGTCACAAC 840
AAGCGCCACT AAAGTTCAGC GATAACTAAC GTTACTGTAT TTGTAATGCG GATAAATAGG 900
TTTCGTTTTC TTTTTTTAAA AATGTAGACC TACAGCTATG TGTTAACTTT ACATCTATTT 960
GAACGGATCA TTGCGCGCGC TCTTGCTCTC TCAGTGCATC ATTTAAAATG GCGCGGCCCG 1020
CTCTTTTAGA GCATAACGCC CACTTTACAA ATTACTACTA ACTTTACAAA TTATTAATAG 1080
TTATTAAAAA GGACTAAGCA GCTAAAAATA GCTTATCTAG TAAAGTAGAC AGTATTGCAA 1140
ATAACGTGCA GTGGTCAAAA CGATTAGTCA CAACATCATG GGCTATTAAT TAGTTCACAA 1200
AACAGCAAAC AATTTCACAA AGTGCAGGAA ATAAACAGAT TACTGATACT ATACAAATAA 1260
AATCAAAGTA GTAATTAAAA CGAAAAGTTT ACCTTGATTT ACAGCAGTAC ATCTTCTCAA 1320
TATGAAATCC TGTCCTTCAA TGGCGGTGCT GGGTGGCGGT TGGTTGTGAC TCGGGATGGT 1380
GGATGGGAAA TCACCACCCA GTACGCATGC GTAACAGCAT GGCTTAGCCC TTATAAGCAA 1440
TTTTACTCAA ATTACATTAG TTATGGGAAC TTTATACCTT ACTATGTCAG CAACACTAAT 1500
GCATTTCTAG TAAACTCAAC AATTAGCCTA AAATTAAGTA AACACACTAG AATTTTGATA 1560
GTAAGGAATA CTATTCGCAT TTACAGTGTA GAC 1593