EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25227 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:47427421-47428499 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF5MA1420.1chr3:47428340-47428354AGTTTGGGTTTCGT-6.04
IRF8MA0652.1chr3:47428340-47428354AGTTTGGGTTTCGT-6.04
IRF9MA0653.1chr3:47428340-47428355AGTTTGGGTTTCGTT-6.99
Lhx3MA0135.1chr3:47428464-47428477TAATTAATTATAC+6.12
ZNF143MA0088.2chr3:47428273-47428289AAGTGCATTATGGGAC-6.48
Enhancer Sequence
AGTTCACTTA ATCTGTCAAG TTAATGTTTC CAAATTTAAT TTTAGGATTA GTGTAGAGAT 60
ATTTGTGCGA TATATTAAAC AGTAGGATAT ATGTGTTACT ATATTTCTAC ACAAATCAAC 120
TTACCATTTT GCCTGTGAGA TGATAATTGG GTGAAAATCC CATTGATCCG GAACCATCTA 180
TAGGGTATAT AATAGCATAG AGGCTCTTAT ACTGTAGCAA CAAACCAGCG TTCCATAGCA 240
ACCACTCAGA TCACCCTACC AACCACACAG CAATGTGCTT CCATTGTTCC CCTTATATTC 300
AGAATAAAAA CAAATCACAC GTATTAGGAT ATAATTTGCT TTAATGTTCT CTATGCAGTT 360
TCTTATGACT CAATAGGCTT TTTCATACGC ATCAGTCTGC ATTTTGCTAA TTGCAGTGTA 420
TAATAGCACA CAAGAATGTC CCCAGAAGCT TTTAGAGTCA TTTGTGTGTC TTGGGGGATT 480
TCTTACAGTA ACCTTGTTGA TTGCCATCTT TAAATACGAT TAACACACAA TGCAAATGAC 540
AGTTTTGCAA TGCAAATTGA ATCATTAACG CTGCTCTACA CACATCCTCA ACACTGAAGC 600
TATTCATGCC TCTCTCCCTC ACTCTCTGGA AAGGTGACGT TGATTATTTT TCTCAGTCAC 660
GTTTGCTAAA TGCTGATTGC CATTTGGAGA CCTTTTACTC CAGACATTGA TTTCATTTTT 720
AAACGACTTA TTCTCTCTGT ATCTTCAACC GCTGCACATA ATGTCTGTTT TAGGGATGCC 780
CCGCAGGGAA ATTACATGCA CTCTAAAAAT CTGTTAATTA TCAGATTATT TTGTGTGTCA 840
TGAGGGTTTT TAAAGTGCAT TATGGGACAG ACTTCTGAGA CCTGGTTGCA TAAAGCCAGT 900
TTTGGCTTTT ACCCAAGTAA GTTTGGGTTT CGTTTGAACA AACTTTGAGT TTTTGGGTTT 960
CATTGCATGG TATGACATGC TATTTGGCTA TCCTGCTCCA GTGCAGTTTT TGGCCTCTTT 1020
TTGCTTGCAA TTTATTTATA TTATAATTAA TTATACTTTA TTTTATATGT ATCAAATA 1078