EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25224 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:47355128-47356496 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr3:47355385-47355396ATATTTACATT-6.32
FOXC2MA0846.1chr3:47356315-47356327TAAGTAAATAAA+6.07
Foxd3MA0041.1chr3:47355788-47355800AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:47355792-47355804AAACAAACAAAC-6.32
ZNF384MA1125.1chr3:47355711-47355723TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:47355712-47355724TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:47355713-47355725TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:47355714-47355726TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:47355715-47355727TTTTTTTTTTTA-6.37
Enhancer Sequence
CTATTGCGAC CCCTGATTAA AGGGACTAAG CCGAAAAGAA AATAAATGAA TGTTACAGAT 60
CCCATTTTAA ACGTTAATGT GTCTCAAAAT CTTTAAACAT TTGGTCTAAT TGCAATTAGA 120
CATGTTTGAT TTGTTGACCT TTTAAAAACA TTTATTTCCT TCACTGAAAA TACATGCCAT 180
TTCAGCCAGG ATCAAATGAC CTGAAAATGA AGAATATGTT TACAGGCTAA TTTGACTTAA 240
TAAGCTATTT GTATGTCATA TTTACATTTC TCATCTAACG TTAATATGAG TCCGAATTGT 300
TTGACAAATA TCTAATTTGA CAATAATGTT TGTGAAGTAA ACACGTCTCT CGAATGAGTG 360
CAGTTTCATG AGGTGACTGT ACAGACACCT TAAACAAATT AAACAAATCC ATCATCTGCT 420
GCGTCACTTC CTCTGCATGT TCGCGAGCAC TGCTGTTTGT TTTTAGCCTG TCAGCTGACA 480
AACTGCATGT CAAAACAAAA CCCAGACAAT TAAATATAAT TATTTGTAAT TACTGGCATC 540
ATTACACGCA ATAACAACAA ACTACGTTTA AACACATAAA GTGTTTTTTT TTTTTTTTAC 600
TATTATTATA TAAGTACATC TGAAATCACA AGTCCAAGCT CTTCGTTTTC AAAAGCACCC 660
AAACAAACAA ACAAACACTT GATTAAATGA CCTAATAACA CTGACAGAAT AAAACTTACT 720
AAAGTAAAAC CCCTCCCGAA ACACTAAGCT GCTTAGCCAA GATAGCAAGT GGCTAATTTA 780
AACACTTATA AATAAAGATA CGGCTCCAGG ACATGACTGA ATGCCCTGTT AGTCGGGTCT 840
GATGCTGTGT TCTTCATCAT TTATACTCAC GGCTGGGCTC TTGGTCTTGG CCATGGAGGT 900
TTTCTGCTAA TGTTTCATTA CTGAGCTGTA GTGTAGTGGA GGTAGCCGCG GCTCCTGTTT 960
CTCCTGCCAG CTCTGACGTC AGACCACAAC AACAGCTCAC GCAGTGAAGA ATAACAGAGG 1020
CTGCAGTGCT CACGGTGGCC AGCAGAGCGC AGCACAACAC AGACCATGAA CTTGAGACGG 1080
TTGCTCAAGC CAAAGAAAAG ATGCAGGCCA TTAAATAAAC CCACTCCATG AAGAGCAGTG 1140
CCAAATTCAA CAAAAAAATA AATAAATAAA AAATAAAAAT AAATAAATAA GTAAATAAAT 1200
AAATAAAATA ATTTATGTCT TGCAGTTAAC ATCGTTCTTG GTGACAGCAA CAGGTAAACA 1260
ACCAAGCACT GGTGTTGGAT CACGGGAAAC GTCACCAGTT TAACAGAGGG AGGCAGCAAA 1320
GAGTCGTTTT TAAAATGTGT CTCATACATA GACTTTGGCA GGATGGAA 1368