EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25207 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:46254491-46256256 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF3MA1418.1chr3:46256142-46256163ATGAAAATGAAATCGAAAACA+6.14
RESTMA0138.2chr3:46254691-46254712GCTGCTGTCCAGGGTCCTGAA-9.38
Spz1MA0111.1chr3:46255902-46255913AGGGTTACAGC+6.14
Enhancer Sequence
GAAATGAACA CAGGTTTCGG ATGGGAAAAC TTTCGCAGCT TTGTTTTTGT AATCGCACAC 60
GATCTGCTAA GATAAGCTTA TTTGCCGTGC ACATATCGCA CAAATGGCTA CTCGGTAAAA 120
TCTAGTGACT GAAGACTGAA AGAGGCTATC AGCTGTCAGT TTTATGGCTG AAGGCGAACT 180
CTAGCGGCAA ACCAACCCAG GCTGCTGTCC AGGGTCCTGA AACCTTTGGC GATATTCTGG 240
AGATGTAAGC GAATAAAAAC ATAAGATTGT CAAACATCAA CATCGCTAAG TGAGACGCTT 300
CAGAGTTCAG CAAACCTGAA CTAGCGCGTT TACTTGGTTA ATGTAGCTTA TGAATCCCCA 360
TAATATCGCA GAAATGCATC GCGTGTCAAA TTACCCCATG AATAATGTCA AATGATTCCA 420
AAAGAACGCG CTCACAAGTC GCGTACACAT TAAAGCGTCG ATACAATTCA GCATTAATGT 480
AAAACGAAGC AAATTAACGC TCGTTCTTAC GAGCGCAGTC AAACTCTACC CATAGACGAT 540
GCATTTCTAA GTTCGACAAG TCGCAACGAG GCATTTGTTG CAATTTCGCG AATGTACAAG 600
AGCTACATGG ATAACTTACA TTTCTCAGAA TACACTTGCG CTCATTCCGT TTCTCGTCCG 660
ACAAACCCAA CATTTGAAGC GACGTAGATG CGACATTCCA AAGCATTTCT CACTTACCTC 720
TTTCGCAGAG CGAAGCAAGA GTCTCTCCGT AACCAAACCA GGGTCCCTAT GTCACCATGT 780
ACCCCCTTGA CATTTTCTAA GAGGCAGTAG ATACCGGACG GGGGCAAAAA AAGCACAAGG 840
TTCCTCTTGG CCTCGGAATA CAAAGAGCTG CAGCTCCTCA CTGCGTCAAG CGCGATCCTC 900
AAAGATCCAT TAAAGAGCGA GTGATTAATT CAAGGCAGAG CCTTTATGTA TTCCGCACAG 960
ACAGAGACAT GGCAGAGTAG TTTTGTCTGT CATAACGCGA GCGACAGCGC CTTATAACTA 1020
TTTCCAGTCA TTTATTAGTT GAGTTGAGGA GCGGGACTAG AGCACTGCTC ATCCACAAGT 1080
CCAGTTAGGG CAAAGTTAAA TCTCATAATA AGATTGTAGG TTACTGCGAG GCTATAAATG 1140
GTGTGGGTTC GACACTGAAG GCAAGAGGGA TGTGTGCCAC GTGAGAGAAC TGTACAGTGC 1200
AAAATGTGAC ATGTTAACAC ATCACTTTTA CACAGCAAGC AACTAAACTC GGAGTTACTT 1260
GCGAATTTTA ATTCGACTTG AAGAAGCACA GGAAAACAAT GACGCCGCTG GTCGACGGAG 1320
GAATATGTGG ATTATTTAAT TATATGCGAA GTTAGAGCTA TCGCAATACC TGTTGTGCGT 1380
GCTATTGCTT TTTTATAACG TGGTTTAGTT AAGGGTTACA GCTGACAATG TATAGAACTG 1440
GAATTTAAAT ATGCTACAGC TATTTCAACA TCGCTAATGT TGTATCGAAT GACTGATCAT 1500
GCTTGATTAT TTAATACAAC GCAGTGCAAT AGCCAACTGA ATAGTGGATT AAAAGTAGTT 1560
TAACCTTTGT AGGACACATA TTAAACAAAT GACTGTTAGA GGACGTTGTA ATGCATAATA 1620
AAACAATACG ATCTGTGCAG ATTGATTATT GATGAAAATG AAATCGAAAA CACAGCATTA 1680
TAATACTATT CTCCAATAAA CGACTCGGTT GAGCTGATTC TTTTAGTGAA TCAAAAACGC 1740
CCAAAAACAG TTAGAGGGTT CGGGT 1765